陳育毅教授兼任教育機構資安驗證中心主任，為資料治理與資安管理領域專家，執行的相關計畫包含：2015年迄今教育部委託「教育機構資訊安全與個人資料保護管理制度驗證中心補助計畫」、2015~2023年教育部委託「台灣學術網路(TANet)台中區域網路中心基礎維運與資安人員計畫」、2016年國網中心委託「資訊安全開放資料平台研發與惡意程式知識庫維運」、2020年迄今國教署委託「國立高級中等學校校務行政系統及國教署委託建置資通系統安全性檢測計畫」。

2015~2023年曾任中興大學計算機及資訊網路中心主任，任內爭取及執行的重要外部計畫：2015~2017年獲得國科會「智慧綠色校園暨所屬場域之雲端管理系統建置與推廣」計畫執行，大幅提升資訊中心機房節能成效達到銀級標準，並於計畫中投入虛擬主機軟硬體建設，具備支援全校系統集中化所需的虛擬主機服務量能；2016~2019年主導本校獲內政部補助的「多元智能永續校園建置計畫」，投入智慧校園建設，包含多項校園安全應用系統及APP開發、校園空氣品質檢測系統、校園視障行動友善服務系統、智能節電空間管理系統，並於2017年獲頒內政部建築研究所「第十屆智慧綠建築設計創意競賽創意狂想巢向未來」佳作獎項。

陳育毅教授在電子商務領域的投入，於本校管理學院成立「前瞻無所不在商務實驗室」，自2011年起培訓學生團隊開發多項應用服務與多次競賽獲獎，其中包含學生參與跨校團隊於「2018年微軟潛能創意盃(Imagine Cup)台灣區競賽」榮獲第一名。陳育毅教授於2012年榮獲本校「101學年度教學特優獎」，2013~2014年指導學生獲得教育部「大專校院資訊軟體人才培育計畫創作成果加值研發」計畫四項，培育學生團隊表現優異，陳育毅教授於2015年榮獲教育部資訊軟體人才培育計畫「表現傑出人員奬」。另外，陳育毅教授與其他學者跨領域合作經驗豐富，2014~2016年負責本校人社中心與中研院合作的「數位人文創新價值體驗應用研究計畫」，擔任總主持人連續執行兩期計畫帶領團隊投入數位人文創新研究。