A sede da Escola Pública de Sustentabilidade está localizada junto à Secretaria Municipal do Meio Ambiente no Parque Ambiental Banhado da Vergueiro. Ela possui a parte externa do parque como uma sala de aula a céu aberto. Além disso, conta com uma estrutura física de uma sala de educação ambiental.

As ambiências desta sala são divididas em laboratório com microscópios, lupas e materiais de experiências químicas e biológicas; auditório com equipamentos audiovisuais; áreas de trabalho com materiais pedagógicos, reutilizados, tablets e óculos de realidade virtual; e espaço lúdico com áreas de interação e didáticas para o público infantil.