a.中華學術院佛學研究所：國內佛學研究之先驅

1978年，創辦人聖嚴法師應教育耆宿張其昀之聘，以國際知名佛教學者身份擔任中華學術院佛學研究所所長。1979年起積極籌備培育人才工作；1981年起招收研究生，修業三年，課程以佛學專題，以及梵、巴、藏語文為主。另側重英、日語之應用教學，以培植國際弘法人才為目標。但因緣變化，1985年，中國文化學院改制，中華學術院佛學研究所停止招生；聖嚴法師遂另創中華佛學研究所於北投，並受聘任為所長。

b.中華佛學研究所：專業佛學教育之深根

1986年，北投「中華佛教文化館」改建為新大樓，1987年向教育部申請立案，於同年7月1日奉准正式成立，該年也發行《中華佛學學報》創刊號。前後20年期間接續聘請方甯書教授、李志夫教授、果肇法師、果鏡法師繼任所長；2001年，位於金山的法鼓山世界佛教教育園區第一期工程完工，中華佛學研究所遷入，法鼓山「大學院教育」至此規模初具。

c.法鼓人文社會學院籌備處：人文社會學院之籌備

1992年，本校提出設立「法鼓人文社會學院（法鼓大學）」之申請並成立籌備處，隔年7月21籌設案審核通過後，成立籌設委員會並聘任第一屆主任委員（聖嚴法師），1998年教育部函核准「法鼓人文社會學院」之籌設；直至2014年，歷經22年篳路藍縷，四任籌備主任，完成校地整建、校舍興建，法鼓人文社會學院正式獲准成立。

d.法鼓佛教學院：單一宗教研修學院

2006年，本校以25年辦學經驗為基礎，與國外十多所知名院校締約之國際化績效，培養多位畢業生在國際取得博士學位的成果，向教育部提出申請，設立單一宗教學院獲准，2007年4月8日，舉行揭牌儀式及首任校長惠敏法師就職典禮，成為全國第一所獲教育部核可之獨立的單一宗教研修學院，並於2008年8月1日正式更名為「法鼓佛教學院」。

e.法鼓文理學院：第三類私立綜合大學

2014年7 月28日，教育部舉行「法鼓人文社會學院」與「法鼓佛教學院」合併審議會，通過兩校合併，校名為「法鼓文理學院」。教學單位，主要涵蓋兩個院所架構，第一、原「法鼓佛教學院」繼續以「佛教學系」招生；第二、原「法鼓人文社會學院」則以「人文社會學群」招生，並於2015年秋季入學第一學期之新生，達成大願興學之重要里程。