Caso necessário DELETAR uma SKU, é necessário prosseguir na sequencia. 

Zerar Estoque - Inativar SKU – Deletar.

O procedimento de deletar pode ser feito tanto por planilha no Seller Center, quanto via API na chamada: ProductRemove

Documentação:

https://api.sellercenter.com.br/docs/

Chamada:

/v2/import/product-removal