Servicios genómicos
Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo, A.C.
es parte de los Centros Públicos de Investigación del CONACYT
El Laboratorio de Genómica Microbiana en conjunto con el Laboratorio de Diagnóstico Molecular ofrecen servicios genómicos de la más alta calidad
El Laboratorio de Genómica Microbiana pertenece también al Laboratorio Nacional de Nutrigenómica y Microbiómica Digestiva Animal
Servicios
Genómica
Secuenciación de genomas microbianos (bacterias y virus)
Metagenómica
Secuenciación metagenómica shotgun a baja profundidad
Preparación de librería para secuenciación (Nextera XT)
Identificación
Bioinformática
Infraestructura
Secuenciación
Contamos con dos equipos de secuenciación de nueva generación:
Illumina Miniseq
Además contamos con todos los equipo necesarios de biología molecular:
2 termocicladores de gradiente
2 termocicladores de tiempo real
1 PCR digital
1 Bioruptor
1 Analizador de fragmentos
Equipos menores
Bioinformática
Contamos con servidores dedicados a análisis bioinformáticos
Dell PowerEdge R810 con 64 núcleos (4 AMD Opteron Processor 6272 x 16 cores ea.), 128 MB RAM, 8 TB HDD (1 HDD de 1 TB /data; 1 HDD de 1 TB /databases; y 3 HDD de 2 TB).
System76 Starling Pro ARM con 96 núcleos (2 ThunderX_CP 64-bit ARMv8 48 cores ea.), 128 MB RAM, 16 TB RAID. Con sistema operativo Ubuntu server 16.02 LTS 64-bit.
Dell Precision T7500 con 12 núcleos (2 Intel Xeon X5650 2.67GHz, 6 cores ea.), 48 MB RAM, 11 TB RAID, con sistema Ubuntu 10.02.
Servidor NAS QNAP TS-853U-RP con 5 TB en RAID para respaldo y otras aplicaciones. Usado para respaldo de información y para compartir archivos.
Personal
Dr. Bruno Gómez Gil R
Responsable
Inv. Titular / SNI nivel III
Personal Técnico
Gestión de Calidad
M. en C. Karen Enciso I.
Secuenciación
Alejandra S. Díaz S.
PCR y librerías
M.G.I. Daniel Fregoso R.
