El CEI del SEMS es el centro que articula los CEI de las escuelas preparatorias, cuenta con un reconocido prestigio entre las instituciones y organismos que fomentan el emprendimiento en el estado de Jalisco y pone en marcha metodologías pertinentes y vanguardistas y por su reconocida capacidad e vincularse con organismos nacionales e internacionales para la incubación y desarrollo de proyectos emprendedores entre la comunidad educativa.