Research

DNA metabolism 

1. 데이터 베이스 기반 타겟 설정

-PDB, GEO database …

-병원균의 주요 대사과정 파악

-전사인자 단백질의 ligand 파악


3. 단백질의 삼차원 구조 규명

-APO form, complex form 단백질의 결정화

-X-ray  회절 사진

-Phenix, CCP4 프로그램을 이용한 삼차원 구조 분석

2. 단백질의 기능 및 작용 기작 연구

-타겟 단백질의 클로닝 및 정제

-protein assay

(Ex : EMSA)

-Mutation에 따른 활성 변화 assay

4. 타겟 – 연구 결과 및 활용 방안

-단백질 타겟 신약 후보물질 개발

-유전자 전사조절 기반 질환 치료법 개발

Structure Based Drug Design

1. 데이터 베이스 기반 Inhibitor 후보군 설정

-Autodock vina, Drug bank …

-가상 Screening 을 통한 타겟-저해제 결합방식 예측

-Kinase 와  Drug의 예측 친화도 그래프

-천연물 inhibitor  후보군 선정

3. 타겟 – 저해제 복합체 구조 규명

-타겟 – 저해제 복합체 결정화

-X-ray  회절 사진

-Phenix, CCP4 프로그램을 이용한 삼차원 구조 분석

2. 저해제의 기능 및 작용 기작 연구

-타겟 kinase 의 클로닝 및 정제

-Kinas assay 

(Ex : kinase FRET assay)

-Mutation에 따른 Kinase 활성 변화 assay

4. 타겟 – 연구 결과 및 활용 방안

-타겟-저해제 스크리닝

-타겟 Kinase에 대한 저해제의 효과 파악

-Kinase 관련 신약 개발에 도움