溪洲川流學的階層式課程設計在第一階段「基礎課程」6小時，運用科技融入，介紹學校周邊的人文景觀及環境問題，屬於校訂必修課程，凡本校學生都必須修習。第二階段「進階課程」，結合多元選修課程，為一學分18小時，主要融入資訊科技介紹、運用及實作，並加入實察體驗，發展多科協作的課程設計。最後為社區環境議題創意提案發表，修課學生整合在課程中對於瓦磘溝生態環境的瞭解，以及培養學生的科技展示能力，創意與自信展示小組的提案以爭取評審青睞。

經提案發表甄選出來優秀的前二組，可進入第三階段「菁英課程」，即本研究提出之「參與式計畫」，藉由計畫獎金及圓夢動力，激發學生的參與力、合作力、規劃力與執行力。最後一階段的自主課程，是以開放空間論壇概念實施，嘗試以學生為本位建構出自己學習地圖，即設置開放空間會議，讓學生發聲，聚焦在學生主體的開放空間會議，目的在培養學生表達論述以及解決問題的能力，進而涵養領袖品格的高階課程。