Činnosť Združenia rodičov sa riadi zásadami demokracie a delegovanej právomoci. Svoje orgány a zástupcov ustanovuje a odvoláva na základe volieb.
Hlavným článkom organizačnej štruktúry Združenia rodičov sú Triedne združenia rodičov.
Najvyšším orgánom Združenia rodičov je Rada rodičov.
Ďalšími orgánmi združenia sú: Výbor rady rodičov v zložení predseda združenia, pokladník a revízor.