14. 以寡核酸微陣列調查台灣貓隻流行性感冒病毒基因學暨病毒特性之分析 (2020/08/01-2021/7/31)(主持。科技部)
13. 建立禽流感新型高病原性病毒快速篩檢及全球的偵測、流行病學與防控強化之道 (2018/03/27-2019/03/26)(主持。行政院農委會)
12. 開發寡核酸微陣列系統檢測台灣地區狗多重MDR1基因型以及其基因型多樣性與化療副作用相關性的研究 (2017/11/01-2018/10/31)(主持。科技部)
11.犬低病原性流感病毒H6N1跨物種感染研究分析 (2016/08/01-2018/07/31)(主持。科技部)
10. 與人類飼主曝露於相同家庭空污環境下之伴侶動物做為慢性氣道問題自發疾病動物模式的延續性研究：探討室內PM2.5與臨床呈像關聯性及建立可追蹤長期預後之研究世代 (2016/08/01-2018/07/31)(共同主持。科技部)
9. 乳酸益生菌對狗情緒異常治療效果的評估 (2016/10/01-2018/9/30)(研究合作。陽明大學/益福生醫股份有限公司)
8. 發展禽流感類病毒顆粒疫苗同步對抗台灣新型與舊型禽流感病毒 (2017/01/01-2019/12/31)(主持。中央研究院)
7. 室內空氣品質(二手菸等)對呼吸系統與心血管功能影響之自發疾病動物模式: 以與其人類飼主曝露於相同室內空污環境下之伴侶動物為追蹤研究對象 (2015/07/01-2017/07/31)(共同主持。科技部)
6. 新發生家禽白血病J亞群病毒的分子流行病學探討 (2015/08/01-2017/07/31)(主持。科技部)
5. 犬呼吸道病原偵測及分型基因晶片之研發 (2015/06/01-2016/05/31)(主持。科技部)
4. 貓傳染性腹膜炎發病相關宿主因子之鑑定 (2014/08/01-2015/07/31)(主持。科技部)
3. 以環狀等溫增幅與生物晶片系統快速檢測與鑑別診斷家禽流行感冒病毒H5N2、H6N1與H7N9 (2013/11/01-2015/10/31)(主持。科技部)
2. 鑑別診斷高病原性與低病原性禽流感病毒暨重要家禽腫瘤性病毒之寡核酸微陣列檢測系統的開發 (2013/02/01-2013/12/31)(主持。科技部)
1. 野生動物重要傳染性疾病之分子診斷 (2012/01/01-2012/12/31)(主持。台北市立動物園)