โรงเรียนวัดวังพระนอนก่อตั้งขึ้น  เมื่อวันที่  12  กันยายน  พ.ศ.  2481  โดยมี
นายประจงษ์  นาคะปักษิณ  นายอำเภอเมืองสุพรรณบุรี  นายถวิล  วัฎฎานนท์  ศึกษาธิการอำเภอเมืองสุพรรณบุรี  นายพิมพ์  หวลบุดตา  กำนันตำบลดอนกำยาน  พร้อมด้วยประชาชนร่วมกันจัดตั้งโรงเรียนนี้ขึ้นสอนตามหลักสูตรกระทรวงศึกษาธิการ  ดำรงอยู่ด้วยกองการประถมศึกษาใช้ชื่อนามว่า“โรงเรียนประชาบาลตำบลดอนกำยาน 4 (วัดวังพระนอน)”  โดยเรียนที่ศาลาการเปรียญวัดวังพระนอน
พ.ศ. 2497พระใบฏีกาฉัตร สุริวงศ์ เจ้าอาวาสวัดวังพระนอนได้เชิญคุณสำเนา มุกกะนานนท์  มาร่วมสร้างอาคารเรียนพร้อมชาวบ้านวัดวังพระนอน เมื่อวันที่ 15 เมษายน 2501 สร้างแบบ 003 ของกรมสามัญ จำนวน 5 ห้องเรียน ใช้ชื่อนามโรงเรียนนี้ว่า “โรงเรียนวัดวังพระนอน” (สำเนาวิทยานุสรณ์) ปัจจุบันโรงเรียนหลังนี้ได้รื้อถอนแล้ว  จากนั้นโรงเรียนวัดวังพระนอนได้มีการพัฒนามาเป็นลำดับ
ปัจจุบันเป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษา เปิดสอนตั้งแต่ระดับก่อนประถมศึกษา
(อนุบาล2– อนุบาล3) ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1-6 และชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1–3