Thèse intitulée "From Dynamics to Structure and Function of Model Bio-molecular Systems"
Mes travaux ont mis en lumière le rôle fondamental des phonons — signatures vibrationnelles des architectures moléculaires — dans la régulation de mécanismes biologiques essentiels. Ils gouvernent par exemple l’empilement anormal de feuillets β dans les fibres amyloïdes, offrant ainsi des marqueurs structuraux pertinents pour les maladies neurodégénératives, ou encore les transferts de protons activés thermiquement. Cette approche a également révélé que la dynamique basse fréquence de l’ADN pilote l’ouverture concertée des paires de bases lors de la transcription. Ainsi en combinant chimie quantique et diffusion de neutrons, et en m’appuyant sur le lien structure–dynamique–fonction, j’ai pu démontrer que les phonons agissent comme de véritables leviers moléculaires au cœur des processus biologiques.
Representation of the vibrational mode of hydrogenated pyridine-3,5-dicarboxylic acid at 155 cm-1 involved in the proton transfer
Comparison of measured and calculated INS S(Q,w) spectra of PDA
J. Chem. Phys., 2006, vol.124, 234503
J. Am. Chem. Soc., 2006, vol.128, p.2963-2969
The main structural configurations proposed for Kevlar
Comparison of measured (e) and different calculated INS S(Q,w) spectra (a,b,c,d) of Kevlar. The N-H wagging mode is the principle probe of the inter-sheet packing
J. Am. Chem. Soc., 2005, vol.127, p.6672-6678
Effect of temperature on the B-DNA double helix stability
Selected eigenvectors, in a bead representation, showing axial (left), strong radial (middle) and breathing (right) character
Phys. Rev. E, 2007, vol.76, 031917