Koža vodozemaca je tanka, glatka i propusna za vodu. Sadržava mnogo žlijezda koje izlučuju sluz i održavaju kožu vlažnom. U mnogim vrstama koža je mjestimice žarko obojena. Tako upozoravaju grabežljivce da imaju mnoge otrovne žljezde i da nisu "jestivi". Osim zaštitne uloge koža ima još jednu vrlo važnu ulogu-disanje. Kisik iz zraka može kroz kožu ući u krv.Osim kroz kožu izmjena plinova odvija se i u plućima. Vodozemci koji žive isključivo u vodi razvijaju škrge kao organ za primanje kisika.