Namnet Valen härleds ur namnet på fisken mal, som på medeltiden kallades val i denna del av världen (fram till att folket här fick kännedom om det djur som idag heter val). Man menar att Valen med sin långsmala, krokiga och taggiga form liknar den stora, fula malen, med fenor och ”skäggtömmar”. Äldsta belägget för namnet är från 1346, då namnet stavades Hvalen.
Ingen vet hur länge Valen varit bebott. Ur äldre skrifter kan man möjligen utläsa att de funnits boplatser redan på 1400-talet. Att ön varit bebodd på 1500-talet kan man vara ganska säker på.
Före 1815 tillhörde Valen olika markägare, sist Göksholm. Det fanns två gårdar med två arrendatorer på varje på ön – två på öster och två på väster. Den östra gården låg fram till någon gång mellan 1792 och 1843 längre österut än dagens gård, vid södra stranden. Av någon anledning (kanske brann gården) flyttades den till nuvarande läge. 1815 köptes Valen loss av David Davidsson, som kom till Valen som dräng åt arrendatorsänkan på väster, Margareta Krismannsdotter, och Erik Jonsson från Racksäter. Köpeskillingen var 5000 riksdaler. Öarna Foderön och Yttre och Inre Franken verkar ha ingått i köpet 1815, även om det tvistades om Foderöns tillhörighet.
Ön delades i två fastigheter – en östlig och en västlig - 1843. Därefter har de två delarna styckats i samband med ägarbyten och arvsskiften. Östra fastigheten har styckats ytterligare en gång, efter att fastigheten köpts av två bröder från Vinön som skulle ha varsin del. Västra fastigheten har styckats flera gånger i samband med arvsskiften. De östra fastigheterna har sålts ett par gånger medan fastigheterna på västra ön gått i arv ända sedan 1815.
Ett skolhus byggdes på Valen 1907. Bygget finansierades dels genom att de boende på ön, 7 familjer, satsade 16 kr vardera, dels genom lån på 3000 kr i St Mellösa sparbank. Skolan var i drift fram till 1939, och såldes sedan som sommarstuga. Därefter fick barnen gå i Nannberga skola och bo inackorderade. I början på 1960-talet började skolbåt köras till Rävsvik, där skolskjutsen hämtade för vidare färd till Götlunda eller Arboga.
Idag finns 6 jordbruksfastigheter på Valen, samt därutöver ett drygt 10-tal permanent- och fritidsbostäder.