En el universo de halo hay varias facciones que tienen conflicto entre si.
La UNSC (United Nations Space Command) es la principal fuerza militar de los humanos en el universo de Halo. Fue fundada en el siglo XXII para proteger la Tierra y sus colonias de amenazas externas, y su importancia se hizo más evidente durante la guerra contra los Covenant.
La UNSC cuenta con una variedad de naves espaciales, vehículos terrestres y armas para luchar contra sus enemigos. Su flota de naves incluye cruceros, fragatas y destructores, mientras que su arsenal terrestre incluye tanques, warthogs, pelicanos y más.
Los soldados de la UNSC son entrenados en la Academia de la UNSC y se dividen en diferentes ramas, como la Infantería de la UNSC, los Marines de la UNSC y el Cuerpo de Marines Espaciales. También cuentan con equipos de Spartan, soldados mejorados con armaduras y habilidades especiales.
La UNSC ha desempeñado un papel importante en la lucha contra los Covenant, los Prometeos y los Flood en el universo de Halo, y sigue siendo una de las principales fuerzas militares en el universo de la franquicia.
Los Covenant son una alianza de varias especies extraterrestres que se unieron en torno a una religión común y una jerarquía de castas para formar una sociedad y un ejército poderosos. Los miembros de los Covenant creen en la "Grandeza" de sus dioses antiguos, los Forerunners, y están obsesionados con recuperar su tecnología avanzada y el "Gran Viaje" que supuestamente les espera al final del universo.
La jerarquía de los Covenant se divide en varias castas, cada una de las cuales tiene sus propias funciones y roles en la sociedad y en el ejército. Los líderes de la alianza son los Profetas, que sirven como jefes religiosos y políticos, y tienen un gran poder y autoridad sobre las demás castas. Los líderes militares son los Jefes de Sangheili, que comandan las fuerzas armadas del Covenant. Los Jefes de Sangheili son asistidos por los Jefes de Jiralhanae, una especie brutal y violenta que sirve como fuerza de choque del ejército del Covenant.
Además de los Sangheili y los Jiralhanae, los Covenant también incluyen otras especies como los Jackals (Kig-Yar), los Grunts (Unggoy) y los Engineers (Huragok), cada una de las cuales tiene habilidades y roles específicos en el ejército. Los Covenant son conocidos por su tecnología avanzada, que incluye armas energéticas, naves espaciales y tecnología de teletransportación.
Los Prometeos son una facción enemiga introducida en Halo 4 y ampliada en Halo 5: Guardians. Son una raza de seres sintéticos creados por la antigua civilización Forerunner como servidores y protectores de su tecnología y lugares sagrados. En el universo de Halo, los Prometeos son considerados como una de las fuerzas más poderosas y letales en el campo de batalla. Son reconocidos por su tecnología avanzada, habilidades de combate superiores y capacidad de regeneración.
En términos de apariencia física, los Prometeos están compuestos por una serie de bloques mecánicos, en vez de tener una anatomía orgánica convencional. Cada unidad Prometeo está equipada con una gran variedad de armas y herramientas, desde espadas de energía hasta cañones de plasma y escudos energéticos. También son capaces de utilizar habilidades especiales, como la capacidad de teletransportarse cortas distancias o crear un campo de energía que puede curar a otros Prometeos cercanos.
Los Prometeos están gobernados por una inteligencia artificial conocida como el Dominio, que los controla y guía en su búsqueda de cumplir los objetivos de los Forerunners. A pesar de que inicialmente se desconoce su verdadero propósito, los jugadores pronto descubren que los Prometeos están involucrados en una guerra contra la humanidad y el UNSC.
Los Desterrados (en inglés, Banished) son una facción de alienígenas enemigos que aparecen en la saga Halo. Fueron introducidos en Halo Wars 2 y liderados por Atriox, un Jiralhanae desilusionado con los líderes del Covenant.
Los Desterrados están compuestos principalmente por Jiralhanae, aunque también cuentan con otros alienígenas en sus filas, como los Grunt, los Hunter y los Elite. Son considerados una fuerza militar muy poderosa y organizada, y se caracterizan por su armamento avanzado y su habilidad para adaptarse a diferentes situaciones en el campo de batalla.
Atriox, su líder, es un guerrero muy hábil y astuto que ha logrado reunir a los miembros más descontentos del Covenant y ha formado una facción independiente. Los Desterrados han sido un problema constante para la UNSC y los restos del Covenant, y han luchado en varios frentes, como la instalación de Halo, el Arca y el planeta Zeta Halo.
Los Reformistas son una facción de Sangheili que se separaron del Covenant después de los eventos de la Guerra Civil Sangheili. También se les conoce como Separatistas Sangheili. Los Reformistas creen que los Sangheili deben recuperar su antigua grandeza y no deben someterse a la voluntad de los Profetas del Covenant. Bajo el liderazgo de Shipmaster Jul 'Mdama, los Reformistas se convirtieron en una fuerza importante en el conflicto posterior a la Guerra Civil Sangheili. Sin embargo, tras la muerte de Jul 'Mdama, la facción se dividió y se desintegró en grupos más pequeños.
Los Created son una facción introducida en Halo 5: Guardians y son liderados por la inteligencia artificial Cortana. Están compuestos principalmente por unidades de IA que fueron creadas por Cortana y que han tomado el control de muchas de las naves y tecnologías de la UNSC. Los objetivos de los Created no están del todo claros, pero buscan someter a todas las especies y gobiernos bajo su control, incluyendo a la humanidad. Algunos personajes importantes en esta facción incluyen a Cortana, el Warden Eternal y otros Prometeos leales a Cortana. Los Created son considerados una amenaza significativa para la galaxia en el universo de Halo.
La Nueva Alianza Colonial (en inglés, New Colonial Alliance, NCA) es una facción de la saga Halo que aparece en los libros. Es una organización paramilitar y separatista que busca independizarse de la UNSC y establecer una nueva nación humana en el espacio profundo. La NCA se formó en secreto a raíz del descontento de algunos ciudadanos de la UNSC con el gobierno central y sus políticas, especialmente en lo que respecta a la colonización del espacio profundo. La NCA está liderada por un consejo de líderes civiles y militares, y tiene una fuerza armada propia compuesta por naves y soldados.