Ma’had Umar bin Khattab Banjarmasin didirikan tanggal 29 April 2011 M. Tepat nya pada tanggal 25 Jumadil Awal 1432 H, yang telah diresmikan oleh Walikota Banjarmasin H. Muhidin, sebagai tanda dimulai kegiatan belajar mengajar. Berdirinya Ma’had Umar bin Khattab Banjarmasin tidak lepas dari andil bapak H. Zaini Dahlan selaku pemilik lahan dan gedung 3 lantai beserta mushalla yang telah dibangun oleh beliau sebagai bentuk perhatian beliau terhadap pendidikan Alquran. Ma’had Umar bin Khattab Banjarmasin yang berdiri di atas lahan seluas 20 x 20 m2 ini pada awalnya memiliki santri putra.
Pada tahun 2017, Ma’had Umar bin Khattab dijadikan sebagai pondok putri, terusan dari pondok pesantren An-Nashr Batu-Malang. Pada mulanya Ma’had Umar bin Khattab memiliki program Takhassus-Tahfidz, Tahfidz-SMP dan Regular 3x seminggu.
Pada tahun 2020, Ma’had Umar bin Khattab berubah nama menjadi Pondok Pesantren Umar bin Khattab sesuai yang terdaftar di Kemenag di bawah Yayasan Pendidikan Islam Umar bin Khattab. Pondok Pesantren Umar bin Khattab kini memiliki program Takhassus-Tahfidz, Tahfidz-SMP dan Talaqqi Syahadah.
Dengan tujuan sebagai wadah untuk mencetak generasi qur’ani dan mampu menghafal Quran 15 - 30 juz sampai mutqin, memahami kandungan al Quran, dan memahami ilmu dasar Islam dalam 3 tahun.
Selain bertujuan untuk pendidikan Alquran, Pondok Pesantren Umar bin Khattab Banjarmasin ini juga memiliki program ekstrakurikuler seperti Olahraga Memanah, Berenang, Senam, Burdah dan Maulid, dan Majelis Ta’lim dengan tujuan agar santriwati dibekali keterampilan, kemandirian dan wawasan secara global.