Evoluzion

Simulador de procesos evolutivos

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¿Qué es EvoluZion?

EvoluZion es un simulador hacia adelante en el tiempo de genética, desarrollado en Java y diseñado para realizar simulaciones en tiempo real sobre la historia evolutiva de los organismos virtuales. Estos organismos modelo albergan un conjunto de 13 genes que codifican para un mismo número de características fenotípicas. Estos genes cambiar aleatoriamente durante la replicación, y los genes mutantes pueden tener efectos nulos, positivos o negativos sobre la aptitud del organismo, lo que permite modelar efectos tanto de la selección natural y la deriva génica en la evolución de genes.

Diferentes datos pueden ser recogidos periódicamente durante la simulación con el fin de realizar análisis posteriores.

Las proteínas y secuencias de ADN generadas por el programa, se pueden utilizar para llevar a cabo análisis filogenéticos con el fin de evaluar el desempeño de la alineación de secuencias múltiples y métodos de inferencia filogenética.

EvoluZion es muy adecuado para enseñar biología evolutiva a los estudiantes en todos los niveles de una forma intuitiva y pedagógica. Esto es debido principalmente a tres características; i) su intuitiva y sencilla interfaz gráfica ii) la visualización en tiempo real iii) la integración de una amplia gama de fenómenos biológicos en una sola simulación.

Debido a la evidente complejidad para simular organismo vivo real, este programa tiene un enfoque simplificado del fenómeno de la vida, donde solo están presentas los elementos esenciales que la definen (por el momento):

  • El consumo de energía (metabolismo)

  • Cambio de la masa con el medio ambiente

  • Reproducción con copias de su material genético

  • Reconocimiento del ambiente

  • Adaptabilidad (evolución)

What is EvoluZion?

EvoluZion is a forward-in-time genetic simulator developed in Java designed to perform real time simulations on the evolutionary history of virtual organisms. These model organisms harbor a set of 13 genes codifying for an equal number of phenotypic features. These genes change randomly during replication, and mutant genes can have null, positive or negative effects on the organism's fitness, allowing to model effects of both natural selection and gene drift on gene evolution.

Different data can be collected periodically during simulation in order to perform further analyze. In addition, the complete genealogy of extant as well as extinct organisms can be recorded.

Protein and DNA sequences can be used to perform phylogenetic analysis in order to evaluate the performance of multiple sequence alignment and phylogenetic inference methods.

EvoluZion is well suited to teach evolutionary biology to students off all levels in an intuitive and pedagogic way. This is mainly due to three features; i) its intuitive and simple graphical interface ii) real time visualization iii) integration of a wide range of biological phenomena into a single simulation.

Because of the obvious complexity of simulating an actual living organism, this program takes a simplified approach to the phenomenon of life, where the essential elements that define life (at the moment) are present.


  • Energy consumption (metabolism)

  • Exchange of mass with the environment

  • Reproduction with copies of its genetic material

  • Environment recognition

  • Adaptability (evolution)