Rute angkutan kota dan Bus Trans Banyumas
Purwokerto juga memiliki kendaraan umum yang lebih dikenal dengan Angkutan Kota dengan empat jenis berdasarkan warnanya. Angkot warna orange untuk jalur dalam kota, hijau untuk jalur kota-Baturaden, biru dan kuning untuk jalur kota-desa. Jam operasi angkutan kota di Purwokerto tidak 24 jam, hanya dari pukul 05.00 s.d. 18.00 WIB, sehingga untuk alternatif transportasi di malam hari adalah taksi, becak atau ojek. Sejak tahun 2020-an tersedia ojek dan taksi daring dari perusahaan berbagi tumpangan Gojek dan Grab. Khusus Grab menggunakan armada ojek pangkalan terminal.
Namun, semenjak Pandemi COVID-19 angkutan kota Purwokerto (angkot orange) tidak memiliki trayek lagi dikarenakan beberapa ruas jalan di Purwokerto yang menjadi 1 arah efek PSBB. Sehingga trayek yang tersedia tidak dapat dijalankan. Kini, tarif dan rute yang dilalui juga tergantung hasil tawar menawar antara pengemudi dan penumpang.
Saat ini, hanya tersedia Teman Bus Trans Banyumas koridor 3A dan 3B dengan rute Terminal Kebondalem - Terminal Tipe A Bulupitu via Pasar Pon. Namun penumpang dapat berpindah bus selama 90 menit ke rute lain gratis. Rute ini juga terintegrasi dengan Stasiun Purwokerto melalui terminal Pasar Pon.
Sejak 5 November 2021 tersedia Teman Bus Trans Banyumas Koridor 3A dan 3B rute Terminal Bulupitu Terminal Kebondalem PP mulai jam 05.00 - 21.00 WIB. Terintegrasi dengan koridor 1 Terminal Pasar Pon - Terminal Tipe B Ajibarang dan juga koridor 2 Terminal Baturraden - Terminal Notog via Alun-alun Kota Purwokerto. Pembayaran menggunakan sistem non tunai menggunakan uang elektronik brizzi ,flazz , tapcash dan e-money, dan juga menerima pembayaran via QRIS dengan tarif Rp 3.900 Umum, Rp 2.000 pelajar dan mahasiswa, lansia dan disabilitas.
Trayek angkutan kota yang tersedia saat ini hanya Bus Teman Bus Trans Banyumas (K3BM) Terminal Bulupitu - Terminal Kebondalem
Terminal Bulupitu–Terminal Kebondalem (A)
Terminal Bulupitu–Terminal Kebondalem (B)
Rute Trans Jateng
Bus Rapid Trans (BRT) Trans Jateng koridor I dengan rute Purwokerto - Purbalingga diresmikan oleh Gubernur Jawa Tengah, Ganjar Pranowo pada hari Senin, 13 Agustus 2018. Disediakan 14 bus berukuran medium dengan kapasitas 40 penumpang, dengan rincian 20 duduk dan 20 berdiri untuk melayani penumpang pada rute ini. Kelebihan transportasi ini adalah penggunaan fasilitas pendingin ruangan (AC) pada bus, jadwal pemberangkatan yang tepat waktu, serta jarak antar angkutan yang rapat sehingga penumpang tidak akan menunggu terlalu lama.
Koridor Purwokerto - Purbalingga ini memiliki 47 halte. Rinciannya 14 halte ke arah Purbalingga dan 23 ke arah Purwokerto. Berikut merupakan rute berangkat dan rute balik dari Trans Jateng koridor I rute Purwokerto - Purbalingga.
Rute Angkutan Antarkota Dalam Provinsi (AKDP)
Rute Eks Karesidenan Banyumas
Purwokerto - Ajibarang - Wangon - Karangpucung - Sidareja: Asli (Ekonomi)
Purwokerto - Ajibarang - Wangon - Jeruklegi - Cilacap: Famili Muda, Gita, Keluarga (Ekonomi)
Purwokerto - Rawalo - Sampang - Cilacap: Famili Muda, Keluarga, Puji Mulyati, Putra Darma, Satria, Tunggal Putra (Ekonomi)
Purwokerto - Rawalo - Menganti - Cilacap: Keluarga (Ekonomi)
Purwokerto - Buntu - Kroya - Cilacap: Fajar Mulya,Keluarga, Kurma Indah, Putra Kembar, Putri Tunggal, Rejo mulyo (Ekonomi)
Purwokerto - Buntu - Sampang - Cilacap: Famili Muda, Keluarga,Puji Mulyati, Virgo (Ekonomi)
Purwokerto - Purbalingga - Bobotsari
Rute Eks Karesidenan Kedu & Pekalongan
Purwokerto - Bumiayu - Slawi - Tegal: Alvin Jaya, Aries, Bhinneka, Hikmat, Indah Putri, Kurnia,Nugroho, Panca Gemilang, Sami Jaya (Ekonomi)
Purwokerto - Purbalingga - Banjarnegara - Wonosobo: Anugerah, Aries, Cebong Jaya, KSU BP, Merapi, Putra Mandiri, Sri Utami, Teguh, Trans BMS (Ekonomi)
Purwokerto - Purbalingga - Bobotsari - Randudongkal - Pemalang: Amira, Putra Ginanjar, Ragil Jaya, Teguh, El Shanum dll(Ekonomi)
Rute Eks Karesidenan Semarang & Pati
Purwokerto - Semarang (via Purworejo - Magelang): Efisiensi (Non Ekonomi) Santoso, Sumber Alam, Tri Kusuma (Ekonomi)
Purwokerto - Semarang (via Wonosobo): Anjana, Langsung Prima, Maju Makmur, Matrix, Mipha Bersenyum, Tri Kusuma (Ekonomi), Nusantara (Non Ekonomi)
Purwokerto - Semarang - Kudus (via Wonosobo): Nusantara (Non Ekonomi)
Rute Angkutan Antarkota Antarprovinsi (AKAP)
Rute Eks Karesidenan Yogyakarta & Surakarta (via Kebumen - Purworejo)
Purwokerto - Yogyakarta: Santoso, Tetap Merdeka, Tri Kusuma (Ekonomi), Citra Adi Lancar (CAL), Efisiensi (Non Ekonomi)
Purwokerto - Kebumen - Solo: Aladdin, Antar Jaya, Mulyo, Raharja, Sugeng Rahayu (Ekonomi) ,
EKA , Sugeng Rahayu ,Rosalia Indah (Non Ekonomi)
Rute Purwokerto - Solo (via Wonosobo - Bawen)
Purwokerto - Solo (via Wonosobo - Bawen): Dicky Putra (Ekonomi) Rosalia Indah (Non Ekonomi)
Rute Eks Karesidenan Priangan (via Banjar)
Purwokerto - Pangandaran: Budiman, Diana Prima ,Teguh (Ekonomi)
Purwokerto - Tasikmalaya: Aries, Teguh, Budiman, Sakura (Ekonomi)
Purwokerto - Bandung (via Tasikmalaya/Ciharbeuti): Aladdin, Budiman, Harum, Mandala, Perkasa (Ekonomi), Budiman, Sinar Jaya (Non Ekonomi)
Purwokerto - Bandung - Soreang : Budiman (Non Ekonomi)
Purwokerto - Bandung via transjawa : Budiman (Non Ekonomi)
Purwokerto - Bandung (via Tegal - Cirebon): Goodwill, Madona (Ekonomi)
Rute Eks Karesidenan Cirebon (via Pantai Utara)
Purwokerto - Cirebon: Citra Adi Lancar (CAL) (Non Ekonomi), Deddy Jaya, Sahabat,Bhinneka Sangkuriang dll (Ekonomi)
Purwokerto - Cileudug - Kuningan: Citra Adi Lancar (CAL) (Non Ekonomi)
Rute Jawa Timur & Bali (via Yogyakarta)
Purwokerto - Kebumen - Yogyakarta - Solo - Surabaya: Sumber Selamat dan Sugeng Rahayu, Madjoe Berlian (Ekonomi), Eka, Handoyo, Rosalia Indah, Sugeng Rahayu (Non Ekonomi)
Purwokerto - Wonosobo - Magelang - Yogyakarta - Solo - Surabaya: Eka, Sugeng Rahayu (Non Ekonomi)
Purwokerto - Kebumen - Yogyakarta - Solo - Surabaya - Malang: Handoyo, Rosalia Indah ,Sakhindra Trans (Non Ekonomi)
Purwokerto - Wonosobo - Temanggung - Magelang - Yogyakarta - Solo - Surabaya - Malang: Handoyo, Rosalia Indah (Non Ekonomi)
Purwokerto - Wonosobo - Temanggung - Solo - Surabaya - Malang: Rosalia Indah (Non Ekonomi)
Purwokerto - Blitar - Malang: Rosalia Indah (Non Ekonomi)
Purwokerto - Kebumen - Yogyakarta - Solo - Surabaya - Probolinggo - Jember: Sugeng Rahayu (Non Ekonomi)
Purwokerto - Kebumen - Yogyakarta - Solo - Surabaya - Probolinggo - Situbondo - Banyuwangi - Denpasar: Gunung Harta, Mansion, Wisata Komodo (Non Ekonomi)
Rute DKI Jakarta & Banten (via Tol Trans-Jawa)
Purwokerto - Bekasi - Jakarta - Tangerang/Bogor: DAMRI, Dedy Jaya, Daya Melati Indah (DMI), Dewi Sri, Dieng Indah, Laju Prima, Lorena/Karina, Murni Jaya, Pahala Kencana, Putri Jaya, Rosalia Indah, Sari Harum, Setia Negara, Sinar Jaya, Sumber Alam, Teguh Jaya, Kupu-Kupu Ayu, Agam Putra Pratama, PeBePe (Non Ekonomi)
Purwokerto - Serang - Merak: Arimbi/Bima Suci, Laju Prima, Rosalia Indah, Sinar Jaya, Sumber Alam (Non Ekonomi)
Rute DKI Jakarta (Via Belik dan Tol Trans-Jawa)
Purwokerto - Randudongkal- Jakarta : 168 Trans ( Satu enam delapan)
Rute Bandung dan sekitarnya (Via Tol Trans-Jawa)
Purwokerto -Bandung via Slawi : Budiman (Non Ekonomi)