履歴書
学歴
1998/03:鹿児島県立鶴丸高等学校 卒業
2002/03:九州大学 理学部 物理学科 卒業
2004/03:九州大学大学院 理学府 凝縮系科学専攻 修士課程 修了
2007/03:九州大学大学院 理学府 凝縮系科学専攻 博士後期課程 修了 [学位 博士(理学)取得]
職歴
2007/04-2007/05:九州大学大学院 理学研究院 物理学部門 凝縮系基礎論講座I 博士研究員
2007/06-2009/05:京都大学 エネルギー理工学研究所 博士研究員
2009/06-2012/05:京都大学 エネルギー理工学研究所 特定助教
2012/06-2013/03:横浜市立大学 生体超分子システム科学専攻 特任助教
2013/04-2014/09:横浜市立大学 生命医科学研究科 特任助教(改組による所属変更)
2014/10-2023/03:東北大学 大学院工学研究科 応用物理学専攻 助教
2018/06-2021/03:理化学研究所 客員研究員
2020/04-2021/03:新潟大学 理学部 物理学科 非常勤講師
2021/04-2022/09:東北文化学園 非常勤講師
2023/04-present:東北大学 大学院工学研究科 応用物理学専攻 准教授
大学や学会の仕事
2015/01-2018/09:応物Newsletter編集委員
2017/01-2017/12:日本生物物理学会平成29年分野別専門委員(D-36 理論・シミュレーション)
2018/05-2020/04:日本生物物理学会 東北支部会委員(会計)
2020/01-2020/12:日本生物物理学会2020年分野別専門委員(B-10 水・水和・溶液)
2019/11-2021/11:2021年度生物物理学会年会実行委員
2021/01-present:東北大学 ソフトマテリアル研究拠点 兼務
2022/01-present:東北大学大学院工学研究科 先端スピントロニクス医療応用工学共同研究講座 兼務
2022/01-2022/12:日本生物物理学会2022年分野別専門委員(B-10 水・水和・溶液)
シンポジウム・ワークショップ主催
2017年6月22日:第17回日本蛋白質科学会年会 ワークショップ「タンパク質科学における理論と実験の協奏」主催
受賞など
2010年9月:第6回日本生物物理学会若手奨励賞を受賞。「Crucial importance of translational entropy of water in rotation mechanism of F1-ATPase」
2019年9月:第57回日本生物物理学会年会 イメージコンテストのトップ9に入りました。「マニフォールドラーニングを用いたタンパク質2次元投影像の分類」(画像は年会のページにあります)
2019年12月:第47回構造活性相関シンポジウム SAR Presentation Award (Poster presentation)を受賞。「溶液理論を用いたタンパク質-リガンド複合体における水和の大規模解析」
2021年3月:指導した学生が、「日本生物物理学会北海道支部-東北支部合同例会 学生優秀発表賞」を受賞
「深層学習の視点に基づいたタンパク質水和分布法の高度化」2021年7月:指導した学生が日本学生支援機構 奨学金 半額免除に採択
2021年10月:HPCI利用研究課題 第8回成果報告会 HPCI利用研究課題優秀成果賞を受賞。webページ
「低温電子顕微鏡実験と分子シミュレーションの統合による4次元イメージング法の確立」2022年9月:Biophysics and Physicobiology (BPPB) の9th Editors Choice Awards
R. Kojima and T. Yoshidome
"A Measure for the Identification of Preferred Particle Orientations in Cryo-Electron Microscopy Data: A Simulation Study",
Biophysics and Physicobiology, 18, 96 (2021).
日本生物物理学会のホームページにおける紹介文2023年7月:指導した学生が日本学生支援機構 奨学金 半額免除に採択
2024年2月:指導した学生が「令和5年度 東北大学応用物理学コース卒業研修発表賞 」を受賞
「機械学習を用いたタンパク質構造変化データの解析 」
所属学会
日本物理学会、日本生物物理学会、Biophysical Society、日本蛋白質科学会、日本放射光学会、日本薬学会