Ημερολόγιο

Εβδομαδιαίο Ημερολόγιο


  • 8-12/06/2020: Machine Learning and Coarse-Graining

  • 2/06/2020: Uncertainty quantification

  • 11/05/2020: Variational inference in path-space for coarse graining molecular systems. Data-driven modeling.


  • 06/05/2020: Variational inference in path-space for coarse graining molecular systems.

Σχετική βιβλιογραφία: 1. Path-space variational inference for non-equilibrium coarse-grained systems, J.Comp. Phys.,314(1), 2016, 355-383, V. Harmandaris, E. Kalligiannaki, M. Katsoulakis and P. Plechac.

2. Study of the transient dynamics of coarse-grained molecular systems with the path-space force-matching method, Procedia Computer Science, 156, 59-68, 2019, G. Baxevani, E. Kalligiannaki, V. Harmandaris.


  • 04/05/2020: Inference methods for coarse-graining for molecular systems: Force-Matching, Relative entropy, Inverse Boltzmann.

Σχετική βιβλιογραφία: Parametrizing coarse grained models for molecular systems at equilibrium, EPJST, 225(8), 1347-1372, 2016, E. Kalligiannaki, A. Chazirakis, A. Tsourtis, M. Katsoulakis, P. Plechac, V. Harmandaris


  • 29/04/2020: Inference for parametric SDEs

Σχετική βιβλιογραφία: Simulation and Inference for Stochastic Differential Equations, S. Iacus, κεφάλαιο 3 & Σημειωσεις.

  • 27/04/2020: Inference for parametric SDEs

Σχετική βιβλιογραφία: Simulation and Inference for Stochastic Differential Equations, S. Iacus, κεφάλαιο 3.


  • 8/04/2020: Λύσεις 1ου φυλλαδίου ασκήσεων


  • 6/04/2020: SDEs numerical solution, Euler-Maruyama & Milstein

Σχετική βιβλιογραφία: 1. Stochastic Processes and Applications, G. Pavliotis, κεφάλαιο 5 (5.2),

2. Simulation and Inference for Stochastic Differential Equations, S. Iacus,


  • 1/04/2020: Variational inference.

Σχετική βιβλιογραφία: 1. Machine Learning: A Probabilistic Perspective, Kevin P. Murphy, κεφάλαιο 21.


  • 30/03/2020: Hierarchical Bayesian inference. Empirical Bayesian inference.

Σχετική βιβλιογραφία: Machine Learning: A Probabilistic Perspective, Kevin P. Murphy, κεφάλαιο 5 (5.5, 5.6)


  • 27/03/2020: Bayesian Στατιστικη συμπερασματολογία.

Σχετική βιβλιογραφία: All of Statistics: A Concise Course in Statistical Inference, L. Wasserman, κεφάλαια 12, 25


  • 23/03/2020: Frequentist's Στατιστικη συμπερασματολογία. Μη-παραμετρικά και παραμετρικά στατιστικά μοντέλα. Μέθοδος των ροπών και Μέγιστης πιθανοφάνειας. Γραμμική παλινδρόμιση.

Σχετική βιβλιογραφία: All of Statistics: A Concise Course in Statistical Inference, L. Wasserman, κεφάλαια 7, 8, 10, 22.3.


  • 04/03/2020: Εισαγωγή στις Στοχαστικές Διαφορικές Εξισώσεις

Σχετική βιβλιογραφία: Stochastic Processes and Applications, G. Pavliotis, κεφάλαια 1 - 3,

Stochastic Differential Equations, B. Oksendal, κεφάλαια 2 - 5.


  • 26/02/2020 : Εισαγωγή στις Πιθανότητες, Στοχαστικές διαδικασίες