Head investigator / 研究代表者

• Yasuhiro Matsunaga (Saitama University) / 松永 康佑 (埼玉大学)

Sub-project 1: Inference of protein dynamics via Markov state modeling  / マルコフ状態モデルを介した構造ダイナミクスの推論

• Yasuhiro Matsunaga (Saitama University) / 松永 康佑 (埼玉大学)

• Kazuma Okada (Saitama University) / 岡田 一真 (埼玉大学)

• Soichiro Oda (Saitama University) / 小田  奏一郎 (埼玉大学)

• Sakura Homma (Saitama University) / 本間 さくら (埼玉大学)

Sub-project 2: Inference of 3D genome structure and dynamics / 遺伝子発現と共役するゲノム3次元構造動態の推論

• Shoji Takada (Kyoto University) / 高田 彰二 (京都大学)

• Giovanni Brandani (Kyoto University)

• Gu Chenyang (Kyoto University)

• Azuki Mizukami (Kyoto University) / 水谷 淳生 (京都大学)

• Syed Hashim Shah (Kyoto University)

Sub-project 3: Inference of protein structural ensemble from CryoEM data / クライオ電顕データからの構造アンサンブル推論

• Florence Tama (Nagoya University)

• Osamu Miyashita (RIKEN) /  宮下 治 (理化学研究所)

• Tingting Wang (RIKEN)

Sub-project 4: Multi-modal inference of protein complex structures / エラー・ノイズを含む実験データからの統合的立体構造推論

• Takaharu Mori (Tokyo University of Science) / 森 貴治 (東京理科大学)

• 井上 紗良 (東京理科大学)

• 大森 駿介 (東京理科大学)

• 坂本 真優 (東京理科大学)

• 佐藤 克樹 (東京理科大学)

• 松原 大都 (東京理科大学)

• 村岡 俊佑 (東京理科大学)

• 村田 景菜 (東京理科大学)

• 山﨑 悠宇 (東京理科大学)

Development of GENESIS for simulation-based inference / 推論システムに向けたGENESISの高度化

• Chigusa Kobayashi (RIKEN) / 小林 千草 (理化学研究所)

• Jaewoon Jung (RIKEN)

Developement of ML/AI methods for simulation-based inference / 推論システムに向けた機械学習/AI手法の開発

• Kazuyuki Nakamura (Meiji University) / 中村 和幸 (明治大学)

• Tsuyoshi Ishizone (Meiji University) / 石曽根 毅 (明治大学)

• Yu Han  (Meiji University)