MEXT "Program for Promoting Researches on the Supercomputer Fugaku"
文部科学省 スーパーコンピュータ「富岳」成果創出加速プログラム 標準課題
Development and application of large-scale simulation-based inferences for biomolecules
生体分子シミュレータを基にした大規模推論システムの開発と応用
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In this project, focusing on a data-driven science approach led by young and mid-career researchers, we will work on solving the inverse problem of sampling structures that satisfy experimental measurement data. Application research will be conducted in each sub-project.
本課題では、生体分子のシミュレータのエンジンそのものを開発するのではなく、若手・中堅メンバーを中心としたデータ駆動科学の観点から、実験計測データを満たす構造をサンプルする逆問題を解くための開発を行い、各サブ課題で応用研究を実施します
Sub-project 1
Inference of protein dynamics via Markov state modeling
Sub-project 1
Inference of protein dynamics via Markov state modeling
Matsunaga group (Saitama Univ)
Sub-project 2
Inference of 3D genome structure and dynamics
Sub-project 2
Inference of 3D genome structure and dynamics
Takada group (Kyoto Univ)
Sub-project 3
Inference of protein structural ensemble from CryoEM data
Sub-project 3
Inference of protein structural ensemble from CryoEM data
Tama group (Nagoya Univ)
Sub-project 4
Multi-modal inference of protein complex structures
Sub-project 4
Multi-modal inference of protein complex structures
Mori group (Tokyo Univ of Sci)
Development of GENESIS for simulation-based inference
推論システムに向けたGENESISの高度化
Development of GENESIS for simulation-based inference
推論システムに向けたGENESISの高度化
Kobayashi group (RIKEN)
小林グループ (理化学研究所)
Development of ML/AI methods for simulation-based inference
推論システムに向けた機械学習/AI手法の開発
Development of ML/AI methods for simulation-based inference
推論システムに向けた機械学習/AI手法の開発
Nakamura group (Meiji Univ)
中村グループ (明治大学)
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