หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาฟิสิกส์การแพทย์ มีความมุ่งมั่นผลิตมหาบัณฑิตที่สามารถบูรณาการองค์ความรู้ทางทฤษฎีสู่ทักษะการปฏิบัติงานด้านฟิสิกส์การแพทย์ ในกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับการใช้รังสี สารกัมมันตรังสี และเภสัชภัณฑ์รังสีทางการแพทย์สำหรับการตรวจวินิจฉัยและการรักษาโรคอย่างมีประสิทธิภาพ มีคุณธรรม จริยธรรม และมีจรรยาบรรณทางวิชาการและวิชาชีพ สามารถถ่ายทอดความรู้ ให้บริการทางวิชาการ และปฏิบัติงานในการใช้รังสีทางการแพทย์อย่างถูกต้องและปลอดภัย มีศักยภาพในการพัฒนาตนเองนำสู่การเรียนรู้ด้วยตนเองตลอดชีวิต (self-directed lifelong learning) เพื่อพัฒนางานบริการทางวิชาการและเป็นกำลังสำคัญในการพัฒนาระบบสาธารณสุขของประเทศ