Някои често срещани проблеми, които SEO одитът може да разкрие, включват счупени връзки, лоша структура на уебсайта, липса на мета тагове и заглавия на страниците, дублирано съдържание и нискокачествено или несъществено писмено съдържание. Одитът може също така да разкрие, че даден уебсайт има малък брой входящи връзки или че много от изходящите му връзки водят към уебсайтове с ниско качество.