La sede B empieza a funcionar, en tres aulas, a finales del año 1973 en un terreno donado, bajo el nombre CED Pastranita. A partir del 2003, mediante Resolución No. 2428 se integra con otras dos instituciones: Colegio Nuevo Kennedy y CED Alfonso López, adoptando el nombre de Colegio Nuevo Kennedy I. E. D. Mediante resolución 08-009 de enero 20 de 2014 se aprueba el cambio por el de Colegio Fernando Soto Aparicio I. E. D. sede B