Madrasah Diniyah adalah sebuah lembaga yang dibentuk oleh Kantor Utusan Agama. Madrasah ini merupakan hasil kerjasama antara sekolah dan Kantor Urusan Agama Kecamatan Dungaliyo. Madrasah Diniyah adalah satu-satunya program kerjasama dengan KUA yang ada di Kecamatan Dungaliyo.