SD. Advent Bengkol didirikan tahun 1963, di samping GMAHK Pioneer Bengkol dengan jumlah murid pada awal 14 orang; laki-laki 9 dan perempuan 4. tahun 1967 Pemerintah memberikan pinjaman tanah sehingga SD. Advent dapat membangun sekolah darurat. Pada tahun 1967-1971, SD. Advent Bengkol kembali melakukan KBM dengan jumlah murid 29 orang. Di tahun 1979, Jemaat GMAHK Pioneer Bengkol membeli tanah sebesar 400m dan mendapat bantuan satu ruangan kelas baru dari Pemerintah. Dari tahun ke tahun SD. Advent Bengkol terus berkembang hingga sekarang.

SD. Advent Bengkol di kelola oleh jemaat GMAHK Pioneer Bengkol, di bawah Yayasan Pendidikan GMAHK Konfrens Manado dan Maluku Utara. Adapun sejarah kepemimpinan SD. Advent Bengkol, dari awal berdirinya sampai sekarang ini :

1. Martinus Ngantung (1963-1966)

2. Manawan (1966-1968)

3. Yansye Pandoy-Pangkey (1968-1971)

4. Ibrahim Thomas (1971-1973)

5. D. Liunsanda (1973-1975)

6. H. H. W. G. O Ratu (1975-1976)

7. Evelyn Tenda ( 1976-1981)

8. Ruth Megawe (1981-1982)

9. Yansye Pandoy-Pangkey (1982-1995)

10. Rugiang (1995-1997)

11. Constantje Wokas-Koapaha (1997-2004)

12. Lily Sinadia (2004-2006)

13. Yenny Rumambi-Mamengko (2006-2011)

14. Wasti Kaunang-Ransingin (2011-2013)

15. Tinny Ingkiriwang (2013-2015)

16. Syanne Roring (2015-2017)

17. Maya Stella Rumaratu-Pandoy (2017-sekarang)