โรงเรียนวัดเขาสะพายแร้ง ตั้งอยู่ในเขตวัดเขาสะพายแร้ง หมู่ ๒ ตำบลสนามแย้ อำเภอท่ามะกา จังหวัดกาญจนบุรี เปิดสอนเมื่อวันที่ ๑๗ พฤษภาคม พ.ศ.๒๔๘๑ โดยกรรมการอำเภอ(นายตี๋ คนธิคามี) เป็นผู้เปิด พร้อมด้วยกำนัน ผู้ใหญ่บ้านและพระอธิการจุ่น ฐานิสสโร เจ้าอาวาสวัดเขาสะพายแร้ง ร่วมกับประชาชน มีนายกิมเส็ง แซ่โค้ว เป็นครูใหญ่ ในปี พ.ศ.๒๔๘๓ นายเจิม พุฒิเครือ มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่ ขณะนั้นยังไม่มีอาคารเรียนได้อาศัยศาลาการเปรียญของวัดเป็นที่เรียนเรื่อยมาจนถึง พ.ศ.๒๔๙๗ ได้สร้างอาคารเรียนถาวรเป็นเอกเทศแล้วเสร็จวันที่ ๒๕ มกราคม พ.ศ.๒๔๙๘ ต่อมาในปี พ.ศ.๒๕๐๔ ได้รับงบประมาณต่อเติมอาคารเรียนเพิ่มอีก ๒ ห้องเรียน เป็นเงิน ๓๐,๐๐๐ บาท และในปี พ.ศ.๒๕๑๑ ได้รับงบประมาณ ๑๗๐,๐๐๐ บาท ก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ๐๐๘ ขนาด ๕ ห้องเรียน ต่อมา พ.ศ.๒๕๑๕ ได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน ๓๕๐,๐๐๐ บาท สร้างอาคารเรียนแบบ ๐๐๔ จำนวน ๘ ห้องเรียน และได้ของบประมาณสร้างบ้านพักครู ๑ หลัง จำนวนเงิน ๒๕,๐๐๐ บาท ในปี พ.ศ.๒๕๓๙ โรงเรียนเข้าโครงการ กศ.พช.

ปี พ.ศ.๒๕๔๐ เข้าโครงการปฏิรูปการศึกษาจัดให้มีห้องคอมพิวเตอร์ ห้องวิทยาศาสตร์ ห้องปฏิบัติการทางภาษา ในวันที่ ๒๕ มิถุนายน พ.ศ.๒๕๔๐ ได้รับอนุญาตให้รื้อถอนอาคารเรียน แบบ ป. ก พิเศษ และได้รับงบประมาณสร้างอาคารเรียน แบบ สปช.๑๐๒/๒๖ จำนวน ๔ ห้องเรียน เป็นเงิน ๑,๐๘๘,๖๐๐ บาท แล้วเสร็จเมื่อวันที่ ๑๘ มีนาคม พ.ศ. ๒๕๔๒ ในวันที่ ๑๓ มิถุนายน พ.ศ. ๒๕๔๕ โรงเรียนได้รับการกำหนดตำแหน่งเป็นผู้อำนวยการโรงเรียน โดยมี นายสง่า นุชลำยอง ได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งเป็นผู้อำนวยการโรงเรียน เมื่อวันที่ ๑ ตุลาคม พ.ศ. ๒๕๔๔ ในวันที่ ๗ กรกฎาคม พ.ศ.๒๕๔๖ โรงเรียนได้โอนจากสำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติไปสังกัด สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ โรงเรียนวัดเขาสะพายแร้ง มีอาคารเรียน ๓ หลัง รวม ๒๗ ห้องเรียน อาคารอเนกประสงค์ ๑ หลัง บ้านพักครู ๓ หลัง ส้วมนักเรียน ๔ หลัง ๑๙ ที่นั่ง สนามฟุตบอล สนามกีฬาอเนกประสงค์ ๒ สนาม และ พ.ศ. ๒๕๕๓ ด้วยการมีส่วนร่วมของโรงเรียน ชุมชน และหน่วยงานองค์กรอื่นในท้องถิ่น ร่วมกันบริจาคสร้างอาคารห้องสมุดพระครูมงคลกาญจน์ จำนวน ๑ หลัง และแหล่งเรียนรู้ภายในโรงเรียน รวมห้องพิเศษต่างๆ โรงเรียนได้รับความร่วมมือและสนับสนุนจากหน่วยงานอื่น ๆ ในชุมชนเป็นอย่างดี ด้านอาคารสถานที่โรงเรียนปรับปรุงภูมิทัศน์อยู่ตลอดเวลา สภาพแวดล้อมเอื้อต่อการจัดการเรียนรู้ทั้งทางด้านวิชาการ งบประมาณ บุคลากร และการบริหารทั่วไป เพื่อส่งเสริมและสนับสนุนการพัฒนาการของผู้เรียนรอบด้าน

สภาพของโรงเรียนในปัจจุบัน ปี 2565 มีอาคารเรียน ๒ หลัง รวม ๑๑ ห้องเรียน อาคารอเนกประสงค์ ๑ หลัง บ้านพักครู ๓ หลัง ส้วมนักเรียน ๓ หลัง ๒๒ ที่นั่ง สนามฟุตบอล สนามกีฬาอเนกประสงค์ ๒ สนาม อาคารพระครูมงคลกาญจน์ จำนวน ๑ หลัง ห้องสมุด ๑ ห้อง ห้องคอมพิวเตอร์ ๑ ห้อง และแหล่งเรียนรู้ภายในโรงเรียน รวมห้องพิเศษต่าง ๆ

ขนาด โรงเรียนวัดเขาสะพายแร้ง เป็นโรงเรียนประถมศึกษาขนาดกลาง เปิดทำการสอนตั้งแต่ ชั้นอนุบาล 1 ถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ ๖ ปัจจุบันมีนักเรียนทั้งหมด ๒๒๖ คน บริหารงานโดย นายสมเพชร จันทะจิตต์ ผู้อำนวยการโรงเรียนวัดเขาสะพายแร้ง