El Máster en Simulación Molecular tiene su origen en las diferentes Escuela de Simulación organizadas por la Red. Se trata de un Título Oficial (código RUCT: 4316581), verificado bajo la modalidad online, que comienza a impartirse en el curso 2018-2019. La docencia corre a cargo de diferentes profesores adscritos a la Red en toda España, así como por profesorador procedente de diferentes universidades latinoamericanas.