Berbicara tentang MTs Salafiyah Syafi’iyah Seblak tidak lepas dari Sejarah Pondok Pesantren Salafiyah Syafi’iyah “Khoiriyah Hasyim” bermula dari pendirian Pesantren Seblak pada 1921 M yang memiliki garis historis dengan Pesantren Tebuireng yang didirikan oleh Hadlratussyaikh KH. M Hasyim Asy’ari pada 1899 M.

Madrasah Tsanawiyah (MTs) Salafiyah Syafi’iyah Seblak merupakan lembaga pendidikan setingkat Sekolah Menengah Pertama (SMP) yang berada di bawah naungan Yayasan Khoiriyah Hasyim Seblak yang didirikan pada tahun 1957 M. MTs Seblak hadir sebagai kelanjutan dari Sekolah Dasar (SD) atau Madrasah Ibtidaiyah (MI) dengan tujuan melanjutkan tradisi pendidikan yang berfokus pada pengembangan ilmu pengetahuan berbasis agama dan karakter Islami.

Kurikulum di MTs Seblak merupakan kolaborasi antara kurikulum nasional dan kurikulum pesantren, dengan fokus pada pencapaian lulusan yang sesuai dengan standar kurikulum nasional dan kurikulum pesantren. Lulusan MTs Seblak diharapkan mampu menguasai dasar-dasar menulis Arab Pegon, membaca Kitab Kuning, hafal Juz 30 dan surah-surah pilihan, serta menguasai program komputer dasar. Selain itu, mereka dibekali dengan kemampuan membaca tahlil dan istighotsah, berbicara dan memahami teks sederhana dalam bahasa arab dan bahasa Inggris, serta memiliki sikap sopan santun, disiplin, dan cinta lingkungan. Kurikulum ini sejalan dengan visi madrasah, yaitu "Terwujudnya Insan Berilmu, Bertaqwa, dan Berakhlakul Karimah, Berdasarkan Ahlussunah wal Jamaah, Berprestasi, Kreatif, dan Inovatif."

Saat ini MTs Salafiyah Syafiiyah Seblak Telah Terakreditasi A.