Su economía está basada en la agricultura, el comercio, la exportación de café, entre otros.
Café
La producción de café en la provincia se realiza con procesos, estrictamente orgánicos y abono mineral, las empresas compradoras más significativas son: Prodelsur (filial de la transnacional Volcafe), Cooperativa Sol & Café, Cenfrocafe, Coopvama, Comercio & Compañía, Perhusac y el Grupo Empresarial Perú Inka. Respecto a este punto, es importante señalar que la producción de café de Jaén ha acaparado la atención por su notable calidad, a tal punto de ser señalada como la nueva Colombia en materia de producción y calidad de café peruano. 3
Cacao
Al igual que el café, el cacao ha sido siempre un producto bandera de la provincia de Jaén, destacando el especial cuidado en cuanto a fertilización orgánica y buenas prácticas agrícolas, lo que lo ha convertido en un producto apreciado y de calidad. Existen muchos productores artesanales de chocolate. Este rubro es tan importante que incluso la Universidad Nacional de Jaén tiene un centro de investigación dedicado al cacao.
Existe una importante cultura de consumo de pescado en la ciudad de Jaén, principalmente de tilapia y trucha. La primera piscigranja jaena es la conocida como Piscigranja "El Dorado" que cuenta con tilapia y camarón gigante de Malasia, hoy en día existen varios piscicultores, destacando "El Rico Pez" que posee incluso un céntrico restaurante donde se pueden disfrutar sus productos entre ellos paiche, paco, tilapia y pacotana.
Producto de su ubicación geoestratégica y de la actividad agroexportadora que se realiza en su entorno, la actividad comercial en la Ciudad de Jaén, que como se ha indicado anteriormente, es la que mayor porcentaje de PEA ocupa, con un universo de más de 2,100 establecimiento comerciales, entre ellos, el Centro Comercial Mega Plaza. La actividad comercial se confirma como una de las actividades económicas más importantes de la Ciudad de Jaén, no solo por su complementariedad con las otras actividades económicas al viabilizar el abastecimiento tanto de insumos como de bienes intermedios así como la venta de los productos agropecuarios que en la zona se producen, sino también por constituir fuente de ingresos monetarios para un buen sector de la población jaena (aproximadamente 4000 hogares según el dato proporcionado por el Censo Nacional Económico 2008), bajo la forma de fuente de ingreso principal (al constituir la actividad principal de la familia) o de fuente de ingresos complementarios de ciertos hogares.
Como centro de redistribución presenta una dinámica similar a la de la Ciudad de Chiclayo y su área de influencia, como se puede apreciar en la lámina N° 04 que muestra los flujos económicos y las interrelaciones que mantiene tanto a nivel interdistrital, como interregional e incluso internacional.
Flujos de salida: Productos agrícolas y pecuarios de distritos aledaños cuyo destino final es Chiclayo, Lima y Piura. Café procedente de centros productores cuyo destino intermedio es el mismo Jaén y Chiclayo para su procesamiento y direccionamiento al Callao y Paita para su destino final: EE. UU., Alemania y Japón.
Flujos de entrada: Insumos, productos de consumo intermedio y final (industriales, fertilizantes, agroquímicos y abarrotes), principalmente de Chiclayo. Productos agrícolas y pecuarios procedentes de Bellavista, Las Pirias, Huabal y San José de Alto, ubicado al norte de la provincia, así como de Santa Rosa (nor oriental de la provincia), para luego continuar con destino a Chiclayo.