กองจักษุกรรมฯ ได้รับอนุมัติจากแพทยสภาให้เปิดการฝึกอบรมแพทย์ประจำบ้านสาขาจักษุวิทยา ตั้งแต่ปี พ.ศ.2529    จบการศึกษาเป็นจักษุแพทย์รุ่นแรกเมื่อ พ.ศ.2532   

ในช่วงแรกเปิดฝึกอบรมปีละ 3 ตำแหน่ง  

ต่อมาได้ขยายอัตราเป็นปีละ 5 ตำแหน่ง 

โดยรับแพทย์จากต้นสังกัดกองทัพบกปีละ 1-2 ตำแหน่ง   

โดยปัจจุบันเมื่อสำเร็จการศึกษา ผู้เข้าอบรมจะได้รับความรู้ความชำนาญตามเกณฑ์ราชวิทยาลัยจักษุแห่งประเทศไทย ฉบับ พ.ศ.2565 รวมทั้งเกณฑ์หลักสูตรแพทย์ประจำบ้านสาขาจักษุวิทยา กองจักษุกรรม โรงพยาบาลพระมงกุฎเกล้า ฉบับ พ.ศ.2565 และผ่านหลักสูตร ป.บัณฑิตชั้นสูง สาขาวิชาวิทยาศาสตร์การแพทย์คลินิก มหาวิทยาลัยมหิดล
นอกจากนี้ จักษุแพทย์ที่ได้รับการอบรมจากกองจักษุกรรม โรงพยาบาลพระมงกุฎเกล้า จะมีคุณสมบัติของจักษุแพทย์ตามผลการเรียนรู้ที่พึงประสงค์ ครบทั้ง 6 ด้าน

กองจักษุกรรม  ฝีกอบรมแพทย์ประจำบ้านต่อยอด จำนวน 2 หลักสูตร เป็นหลักสูตร 1 ปี ปีละ 1 ตำแหน่งต่อหลักสูตร คือ

สาขากระจกตาและการผ่าตัดแก้ไขสายตา และ

สาขาต้อหิน