El Sistema de Estadísticas Continuas (SEC) inició su operación en 1940, año en que la Secretaría de Industria y Comercio (SIC) era la responsable del diseño, captación,procesamiento y presentación de resultados del sector educativo.
A partir de 1972, mediante un convenio de colaboración con la SEP, se establecieron los cuestionarios o formas únicas SEC-SEP, que se recolectaban a través de la estructuraadministrativa de la SEP, aunque todavía estaba coordinada por la SEC.
En 1976 se estableció un nuevo convenio, en el que se delegaba a la SEP la responsabilidad de operar el SEC en forma computarizada y en estrecha coordinación con la Dirección General de Estadística (DGE) de la SIC.
En el convenio se estableció la participación de las unidades y subunidades de servicios descentralizados de la SEP; con esta medida se dan los primeros pasos para alcanzar,posteriormente, el proceso de descentralización del SEC.
Al crearse en 1977 la Secretaría de Programación y Presupuesto (SPP), la DGE pasó a formar parte de esta dependencia, por lo que, a partir de esa fecha, la coordinación se tuvo con la SPP.
En 1978, con el propósito de consolidar el proceso de descentralización de la SEP, se crean las delegaciones generales en los estados y desde el momento se encauza el proceso de descentralización de los sistemas de información, iniciándose precisamente con el SEC.
En cada delegación se crea el Departamento de Información Estadística, que es el responsable, entre otras cosas, de operar el SEC a nivel estatal; más adelante las delegaciones generales de la SEP se transforman en las Unidades de Servicios Educativos a Descentralizar (USED) y posteriormente, en Organismos Responsables de la Educación en los Estados (OREE). La Dirección de Planeación u homóloga en el Estado, a través del Departamento de Estadística, era la responsable de realizar la operación del SEC en coordinación con la Dirección General de Planeación, Programación y Presupuesto, ahora denominada Dirección General de Planeación, Programación y Estadística Educativa.