Cenipalma

Investigador Titular, Director del Laboratorio de Marcadores Moleculares/

Senior Researcher, Director of the Molecular Markers Laboratory

Desde / Since: 05/2002 - 09/2008

Ubicación / Location: Bogotá, Colombia

Descripción

Desde mayo de 2002 hasta septiembre de 2008, estuve vinculado al Centro de Investigación en Palma de Aceite (Cenipalma). Allí llevé a cabo labores de investigación científica para el sector palmero de Colombia.

Mis principales responsabilidades incluyeron:

Ejecutor responsable de la gestión técnica (formulación, consecución de recursops, ejecución, publicación) y administrativa (contrataciones, regulación, propiedad intelectual, manejo presupuestal, aseguramiento de calidad, control y representación) de proyectos de investigación.
Coordinar al personal y las actividades del Laboratorio de Caracterización Molecular.
Supervisar estudiantes de pregrado, maestría y jóvenes investigadores.
Ser miembro del Comité de Propiedad Intelectual y del Comité de Gestión de la Calidad de Cenipalma.
Ser miembro (Presidente 2003-2005 y 2007-2008) del Comité de Publicaciones de Cenipalma y delegado por el Director del Centro para el Comité Editorial de la Revista Palmas y el boletín el Palmicultor de Fedepalma
Organización y participación en actividades de comunicación eficiente de la biotecnología.
Coordinar módulos técnicos de eventos de carácter nacional e internacional (Conferencia Internacional de Palma de Aceite 2004 y 2007).
Representar al Centro en eventos científico-técnicos de carácter nacional e internacional.
Gestionar el establecimiento de relaciones y convenios con diversas instituciones (Universidades, Centros de Investigación, empresas privadas) de carácter nacional e internacional.

Description

From May 2002 to September 2008, I was linked to the Oil Palm Research Center (Cenipalma). There I carried out scientific research for the palm sector in Colombia.

My main responsibilities included:

Executor responsible for the technical (formulation, resource procurement, execution, publication) and administrative (contracting, regulation, intellectual property, budget management, quality assurance, control and representation) management of research projects.
To coordinate the staff and activities of the Molecular Characterization Laboratory.
Supervise undergraduate and graduate students and young researchers.
Be a member of the Intellectual Property Committee and the Quality Management Committee of Cenipalma.
To be a member (President 2003-2005 and 2007-2008) of the Publications Committee of Cenipalma and delegate by the Director of the Center for the Editorial Committee of Palmas Magazine and the bulletin El Palmicultor of Fedepalma
Organization and participation in efficient biotechnology communication activities.
Coordinating technical modules of national and international events (International Oil Palm Conference 2004 and 2007).
Representing the Center in national and international scientific-technical events.
To manage the establishment of relationships and agreements with various institutions (Universities, Research Centers, private companies) of national and international character.

Principales Resultados

Creación y dirección de la División de Biotecnología de Cenipalma.
Definición de políticas de propiedad intelectual del Centro, contratación de consultorías en propiedad intelectual y acceso a recursos genéticos.
Indexada la revista Palmas ante Colciencias.
Ejecutados los siguientes proyectos de investigación:
1. Establecimiento de la plataforma de bioinformática en palma de aceite. En asocio con el Laboratorio de Fitopatología y Micología de la Universidad de los Andes (LAMFU). Se generó una publicación.
2. Realización de ensayos piloto de biorremediación en conjunto con el Centro de Investigaciones Microbiológicas (CIMIC) de la Universidad de los Andes. Se generó una publicación.
3. Validación de marcadores moleculares ligados al grosor de cuesco en palma de aceite. Se generó una publicación.
4. Búsqueda de alternativas de control y empleo de técnicas moleculares para la identificación taxonómica de los agentes causales de la Pudrición de Cogollo en la Zona Oriental palmera de Colombia. Se desarrolló en asocio con el Laboratorio de Fitopatología y Micología de la Universidad de los Andes (LAMFU). Se generó una publicación.
5. Diagnóstico sobre los requerimientos legales y normativos de cumplimiento de Cenipalma para realizar investigación en recursos biológicos y genéticos. Este proyecto se realizó conjuntamente con la Unidad Jurídica de Fedepalma.
6. Caracterización molecular de Elaeis guineensis Jacq. proveniente de Angola. Se generó una tesis de pregrado con calificación meritoria (E. Meléndez, Universidad Francisco de Paula Santander, 2006) y una publicación.
7. Caracterización bioquímica y molecular del banco de germoplasma de palma americana (Elaeis oleifera.) de Cenipalma. Se generaron dos tesis de pregrado (N.J. Herrera, Universidad Nacional, 2005; Y. Rojas, UPTC, 2005), dos proyectos de pasantía (P. López, UMNG, 2005-2006; D.P. Gonzáles, UNIPAZ, 2006) y cuatro publicaciones.
8. Caracterización molecular de palmas Dura. Se generaron dos trabajos de pregrado (C. Galeano, Universidad Nacional, 2004; S. Suárez, UDCA, 2005) y dos publicaciones.
9. Identificación de marcadores moleculares asociados a la pudrición de cogollo en palma de aceite Elaeis guineensis Jacq. Como resultados, más de 150 accesiones de E. oleifera se mantienen en el banco de germoplasma y se estudian a nivel morfoagronómico, bioquímico y molecular. Desde el punto de vista de fortalecimiento de la capacidad en biotecnología, el proyecto permitió establecer vínculos colaborativos con instituciones de Ecuador (INIAP, ANCUPA), Nigeria (NIFOR) y Malasia (MPOB, SDTC, UKM, UPM). Se generaron diez publicaciones.
10. Investigación en reguladores de crecimiento: Poliaminas. Revisión teórica y resultados de este proyecto están publicados en una tesis de maestría (C. Mendoza, Universidad Nacional, 2003) y en tres artículos.
11. Cultivo de células de Mamestra brasicae para la multiplicación de Baculovirus. Los resultados han sido publicados en una tesis de maestría (Z. Ojeda, Universidad Javeriana, 2002) y un artículo.

Main outputs

Creation and direction of Cenipalma´s Biotechnology Division
Definition of the Center's intellectual property policies, hiring consultancies for intellectual property and access to genetic resources.
Palmas magazine indexed in Colciencias.
The following research projects were carried out:
1. Establishment of the bioinformatics platform in oil palm. In association with the Laboratory of Phytopathology and Mycology of the University of the Andes (LAMFU).
2. A publication was generated.Pilot bioremediation trials were carried out together with the Microbiological Research Center (CIMIC) of the Universidad de los Andes. A publication was generated.
3. Validation of molecular markers linked to kernel thickness in oil palm. A publication was generated.
4. Search of control alternatives and use of molecular techniques for the taxonomic identification of the causal agents of the Cogollo Rot in the Eastern Palm Zone of Colombia. It was developed in association with the Laboratory of Phytopathology and Mycology of the University of Los Andes (LAMFU). A publication was generated.
5. Diagnosis on the legal and normative requirements of Cenipalma's compliance to carry out research on biological and genetic resources. This project was carried out jointly with the Legal Unit of Fedepalma.
6. Molecular characterization of Elaeis guineensis Jacq. from Angola An undergraduate thesis with meritorious qualification was generated (E. Meléndez, Universidad Francisco de Paula Santander, 2006) and a publication.
7. Biochemical and molecular characterization of the germplasm bank of American palm (Elaeis oleifera.) from Cenipalma. Two undergraduate thesis were generated (N.J. Herrera, Universidad Nacional, 2005; Y. Rojas, UPTC, 2005), two internship projects (P. López, UMNG, 2005-2006; D.P. Gonzáles, UNIPAZ, 2006) and four publications.
8. Molecular characterization of Dura palms. Two undergraduate works were generated (C. Galeano, Universidad Nacional, 2004; S. Suárez, UDCA, 2005) and two publications.
9. Identification of molecular markers associated to bud rot in Elaeis guineensis Jacq oil palm. As a result, more than 150 E. oleifera accessions are kept in the germplasm bank and are studied at a morphoagronomic, biochemical and molecular level. From the point of view of strengthening capacity in biotechnology, the project made it possible to establish collaborative links with institutions in Ecuador (INIAP, ANCUPA), Nigeria (NIFOR) and Malaysia (MPOB, SDTC, UKM, UPM). Ten publications were generated.
10. Research on growth regulators: Polyamines. Theoretical review and results of this project are published in a master's thesis (C. Mendoza, Universidad Nacional, 2003) and in three articles.
11. Culture of Mamestra brasicae cells for Baculovirus multiplication. The results have been published in a master's thesis (Z. Ojeda, Universidad Javeriana, 2002) and one article.

Publicaciones (en español)

Rocha, PJ. 2010. Avances en biotecnología para el cultivo de palma de aceite: Temas principales en PIPOC 2009. Palmas 31(1):65-76. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ.; Mutis, G.; Restrepo, S. 2008. Generación de La plataforma bioinformática para La palma de aceite de Cenipalma. Palmas 29(2): 19-28. ISSN: 0121-2923.
Clavijo, IV; Rocha, PJ; Vives, M. 2008. Ensayo exploratorio de microorganismos nativos útiles para la biodegradación de glifosato en cultivos de palma de aceite. Ceniavances (Colombia). 161:1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ; Restrepo, S; Sierra, R; Cepero, MC; Rojas, A; Rojas, A; Romero, L. 2008. Ensayos preliminares de la estrategia metagenómica para la posible identificación de agentes asociados a la Pudrición de Cogollo. Ceniavances (Colombia). 160:1-4. ISSN: 0123-8353.
Montoya, C; Rocha, PJ. 2008. Validación de Marcadores Moleculares ligados a Grosor de Cuesco. Ceniavances (Colombia). 159:1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ; Gómez, DM, 2008. Estandarización de la técnica de SSCP en palma de aceite. Ceniavances (Colombia). 158:1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ. 2008. División de Biotecnología de Cenipalma: Generadora de herramientas tecnológicas para el sector palmicultor colombiano. Ceniavances (Colombia). 157:1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ.; Tovar, JP; Gutiérrez, DF; Mosquera, M. 2007. Marchitez Letal en palma de aceite. Boletín Técnico No. 22, Cenipalma. Bogotá. 38p. ISBN: 958-8360-00.
Rocha, PJ.; Suárez, S; Rey, L. 2007. Uso de microsatélites para la caracterización molecular de palma de aceite tipo Dura. Revista UDCA 10(2): 51-63. ISSN: 0123-4226.
Rocha, PJ. 2007. Biotecnología en el cultivo de palma de aceite: Aspectos sobresalientes en Pipoc 2007. Palmas 28(3): 47-55. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ. 2007. Sanidad de la palma de aceite: Diagnóstico e investigación integral liderada por el gremio palmero colombiano. Palmas (Colombia). 28 (2): 87-98. ISSN: 0121-2923.
Meléndez, E; Rocha, PJ., Rey, L. 2007. Ampliación del análisis de diversidad genética de Palma de aceite proveniente de Angola. Revista Respuestas. 12 (1): 20-28. ISNN: 0122 820X
Rocha, PJ. 2007. Cultivo de tejidos: una herramienta valiosa para el desarrollo de la palma de aceite en Colombia. Palmas (Colombia) 28 (1): 53-64. ISSN: 0121-2923
Rocha, PJ. 2007. La biotecnología como una herramienta para agilizar la selección de nuevos materiales en palma de aceite. Palmas (Colombia). 28 (especial): tomo 1: 144-148. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ.; Prada, F; Rey, L; Ayala, I. 2006. Caracterización bioquímica parcial de genotipos de la colección de Elaeis oleifera de Cenipalma provenientes de la Amazonía colombiana. Palmas (Colombia) 27 (3): 35-44. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ.; Suarez, S.R. 2006. Caracterización molecular preliminar de materiales comerciales de palma de aceite en Colombia. Ceniavances (Colombia). 141: 1-4. ISSN: 0123-8353.
Sierra, R; González, A; Rocha, P; Restrepo, S. 2006. Xylella fastidiosa no se detecta en tejidos de palma de aceite (Elaeis guineensis Jacq.) afectada por marchitez letal. Ceniavances (Colombia). 137:1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ. 2005. Aportes de la biotecnología al cultivo de la palma de aceite en Pipoc 2005. Palmas (Colombia), 26 (4): 53-59. ISSN: 0121-2923.
Montoya, C; Arias D; Rey L; Rocha, PJ. 2005. Caracterización molecular de materiales Elaeis guineensis procedentes de Angola. Fitotecnia Colombiana (Colombia). 5(2): 1-10 ISSN: 0123-1286.
Rocha, PJ, Rojas, Y; Rey, L. 2005. Caracterización molecular preliminar del banco de germoplasma de Elaeis oleifera [H.B.K.] Cortés mediante microsatélites. Ceniavances (Colombia) 130:1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ. 2005. Empleo de técnicas moleculares para la caracterización de hongos que afectan la palma de aceite. Ceniavances (Colombia) 128:1-4. ISSN: 0123-8353.
Aldana, J, Rey, L, Rocha, PJ. 2005. Multiplicación de un polinizador (Coleoptera: Curculionidae) en poblaciones nativas de Elaeis oleifera [H.B.K.] Cortés. Ceniavances (Colombia) 126:1-4. ISSN: 0123-8353.
Montoya, C; Arias, D; Rey, L; Rocha, PJ. 2005. Evaluación preliminar de Elaeis guineensis (Jacq.) proveniente de Angola mediante marcadores moleculares. Ceniavances (Colombia), 121: 1-4. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ. 2004. Plantas transgénicas frente a la realidad del mercado. Palmas (Colombia) 25 (3): 55-69. ISSN: 0121-2923.
Arias, D; Rocha, PJ. 2004. Análisis de diversidad genética en materiales tolerantes y susceptibles a la pudrición de cogollo en palma de aceite mediante marcadores moleculares. Palmas (Colombia), 25 (3): 11-27. ISSN: 0121-2923.
Rey, L; Gómez, PL; Ayala, I; Delgado, W; Rocha, PJ. 2004. Colecciones genéticas de palma de aceite Elaeis guineensis (Jacq.) y Elaeis oleifera (H.B.K) de Cenipalma: Características de importancia para el sector palmicultor. Palmas (Colombia), 25 (especial): 39-48. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ. 2004. Conceptos básicos en biotecnología de la palma de aceite. Palmas (Colombia), 25 (especial): 11-17. ISSN: 0121-2923.
Sánchez, NJ; Fuentes, FR; Torres, M; Rocha, PJ; Calvache, H; Gómez, PL. 2003. La marchitez letal no es la marchitez vascular africana causada por Fusarium. Palmas (Colombia), 24 (4): 9-20. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ. 2003. Marcadores moleculares, una herramienta útil para la selección de palma de aceite. Palmas (Colombia), 24 (2): 11-25. ISSN: 0121-2923.
Rocha, PJ. 2003. Derechos de propiedad intelectual, la manera de proteger invenciones. Palmas (Colombia) 24 (1): 9-17. ISSN: 0121-2923.
Mendoza, C; Rocha, PJ. 2003. Poliaminas: Reguladores de crecimiento con múltiples efectos en las plantas. Palmas (Colombia), 23 (4): 39-46. ISSN: 0121-2923.
Mendoza C; Rocha PJ. 2003. Relación de las poliaminas con el complejo de pudrición de cogollo. Ceniavances (Colombia) 105: 1-4. ISSN: 0123-8353.
Ojeda, Z; Rocha, PJ; Calvache, H. 2003. Baculovirus como insecticida biológico. Palmas (Colombia), 23 (4): 27-37. ISSN: 0121-2923.
Rey, L; Ayala, I; Delgado, W; Rocha, PJ. 2003 Colecta de material genético de la palma americana nolí Elaeis oleifera (H.B.K.) Cortez en el Trapecio Amazónico. Ceniavances (Colombia), 101: 1-4. ISSN: 0123-8353.
Airede, C. 2002. Análisis del "nuevo disturbio" de la palma de aceite presente en la Zona Oriental. Rocha, PJ. (traductor). Ceniavances (Colombia) 100: 1-3. ISSN: 0123-8353.
Rocha, PJ. 2002. Teoría y práctica para la extracción y purificación del ADN en palma de aceite. Palmas (Colombia). 23 (3): 9-17. ISSN: 0121-2923.

Publications (in English)

Rocha, PJ.; Rey, L. 2007. Oil palm breeding program in Cenipalma, Colombia: A way to sustainability. Proceedings of the PIPOC 2007 International Oil Palm Congress (Agriculture, Biotechnology & Sustainability) Kuala Lumpur Convention Centre, Malaysia. 927-939.
Rocha, PJ.; Rey, L. 2007. Partial agronomical, biochemical and molecular characterisations of Colombian Elaeis oleifera germplasm bank. Proceedings of the PIPOC 2007 International Oil Palm Congress (Agriculture, Biotechnology & Sustainability) Kuala Lumpur Convention Centre, Malaysia. 1193-1198.
Rocha, P; Mendoza C; Cayón G. 2005. Application of polyamines in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) stops advance of bud rot disease. Journal of Oil Palm Research (Malaysia), 17:167-174. ISSN: 1511-2780.

Presentaciones (en español)

2008

Rocha, PJ. Palma de aceite en Colombia: Biocombustibles, medio ambiente y biotecnología. III Congreso Nacional de Biotecnología y II Seminario Internacional de Bionegocios. Edificio Cámara de Comercio, Bogotá, 29 de julio a 1 de agosto de 2008.
Rocha, PJ. Materias primas para la producción de biodiésel en Colombia: caso palma de aceite. Segundo Taller: “Plan colombiano de I+D+I en biocombustibles (Plan BIOCOM) de Colciencias. Colciencias – Corpodib, Hotel Cosmos 100, Bogotá, 10 de julio de 2008.
Rocha, PJ. Palma de aceite: aspectos de biotecnología, medio ambiente y combustibles. Universidad Nacional de Colombia, sede Medellín. 25 enero de 2008.

2007

Rocha, PJ. Palma de aceite: Biotecnología, medio ambiente y combustible. V Encuentro de Investigadores, Politécnico Colombiano Jaime Isaza Cadavid, Medellín. 20 y 21 de septiembre de 2007.
Rocha, PJ. X Congreso de la Asociación Colombiana de Fitomejoramiento y Producción de Cultivos. San Juan de Pasto, 5 a 7 de junio de 2007.
Rocha, PJ. XXXV Congreso Nacional de Cultivadores de Palma de Aceite, XVII Sala General de Cenipalma, XXXV Asamblea General de Fedepalma. Cali, 30 de mayo a 1 de junio 2007.

2006

Rocha, PJ. Palma de aceite: Biotecnología, medio ambiente y biodiésel. VII Simposio de biotecnología y el sector productivo. Universidad Francisco de Paula Santander, Cúcuta. 8-9 de noviembre de 2006.
Rocha, PJ. Biotecnología en plantas medicinales y aromáticas. II Congreso Internacional de Plantas Medicinales y Aromáticas. Universidad Nacional de Colombia, Palmira. 19 a 21 de octubre de 2006.
Rocha, PJ. La biotecnología como una herramienta para agilizar la selección de nuevos materiales en palma de aceite. XV Conferencia Internacional de Palma de Aceite. Cartagena 19 a 22 de septiembre de 2006.
Rocha PJ. Identificación de marcadores moleculares asociados con la resistencia a la pudrición de cogollo en palma de aceite (FTG-58/99). Fontagro-IICA, Corpoica Ceisa - Bogotá, 26 de julio de 2006.
Rocha PJ. Marcadores moleculares: Generalidades. Curso intensivo en el análisis y usos de la técnica de microsatélites. Facultad de Agronomía. Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, 22 a 24 de marzo de 2006.

2005

Rocha PJ. Reunión anual de investigadores, Cenipalma, Bogotá, noviembre de 2005.
Rocha, PJ. Biotecnología y palma de aceite en Colombia. VI Simposio de Biotecnología y el sector productivo y V Jornada Biotecnológica. Universidad Francisco de Paula Santander, Cúcuta, 9 a 11 de noviembre de 2005.
Rocha, PJ. Plantas transgénicas: Conceptos y aplicaciones. CEIC Colsubsidio. Bogotá, 10 de septiembre de 2005.
Rocha, PJ. Marcadores moleculares y su uso en Colombia. Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia. Bogotá, 6 de septiembre de 2005.
Rocha, PJ. Manipulación genética de las rutas metabólicas en plantas. Corpogen. Bogotá, 29 de junio de 2005.
Montoya C; Arias DM, Rey L; Rocha PJ. 2005. Caracterización de materiales Elaeis guineensis Jacq. Procedentes de Angola. IX Congreso de la Asociación Colombiana de Fitomejoramiento y Producción de Cultivos”. Palmira. 13 de mayo 2005.
Montoya, C., Rocha, P., Rey L., Arias, D. Caracterización molecular de Elaeis guineensis proveniente de Angola. IX Congreso de la Asociación Colombiana de Fitomejoramiento y Producción de Cultivos. Palmira, 11 de mayo de 2005.
Rocha, PJ. Organismos Genéticamente Modificados “Mitos y Realidades”. Departamento de Nutrición y Bioquímica, Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá, 27 de abril de 2005.

2004

Rocha, PJ. Transgénicos: Conceptos y experiencias en la palma de aceite en Malasia y perspectivas en Colombia. Fedepalma. Bogotá, 27 de julio de 2004.
Rocha PJ. y Mendoza, C. Determinación y efecto de las poliaminas en palma de aceite (Elaeis guineensis Jacq.) afectada por el complejo de pudrición de cogollo. XXXIV Congreso Anual de la Sociedad Colombiana de Control de Malezas y Fisiología Vegetal-Comalfi. 5 mayo de 2004.
Rocha PJ. Aplicaciones de la biotecnología vegetal. Universidad de Cundinamarca. Fusagasugá, 23 de abril de 2004.

2003

Rocha PJ. Conferencia Internacional en Palma de Aceite. Cartagena, 22-26 de septiembre de 2003.
Rocha P. Conferencista del diplomado: Biología Molecular. Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia. Tunja, 5 de abril de 2003.

2002

Rocha P. Bud rot complex and Cenipalma´s role. International Workshop: Molecular markers and bud rot complex in oil palm. Bogotá, 9 de diciembre de 2002.
Rocha P. Publicaciones: el deber del investigador (Reunión anual de Cenipalma). Bogotá, 29 de noviembre de 2002.
Rocha P. Aplicaciones actuales de la biología molecular en plantas". Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia, Tunja, 15 de noviembre de 2002.
Rocha P. Tendencias actuales en ingeniería genética de plantas. Seminario permanente "Reflexiones en biología". Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, 23 de septiembre de 2002.
Rocha P. Caracterización molecular de una proteína de resistencia a hongos en cebada. Centro Internacional de Física (CIF). Bogotá, 20 de septiembre de 2002.
Rocha P. Hablemos de propiedad intelectual. Cenipalma, Bogotá, 6 de agosto de 2002.

Presentations (in English)

2002

Rocha P. Bud rot complex and Cenipalma´s role. International Workshop: Molecular markers and bud rot complex in oil palm. Bogotá, 9 de diciembre de 2002.

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