Gracias por participar! nos vemos el año que viene en.... en.... (Santiago!)

se vienen nomás las ediciones subsiguientes: http://pb2018.sitios.ing.uc.cl/

Protein Biophysics at the End of the World es un evento de 3 días que reúne a investigadores sudamericanos en una serie de simposios, workshops y keynotes.

Se incitará al intercambio entre investigadores de diferentes ramas que confluyen en el estudio de las moléculas más interesantes de las biósfera. QuímicaFísicaComputaciónMatemáticaBiología y más...

Simposios, Workshops y Posters ! Vení a discutir tu trabajo y a conocer de cerca los demás !

La inscripción es gratuita e incluye coffee-breaks para todos los participantes. Si necesitas ayuda financiera, hay becas PABMB !

Conferencistas plenarios

Francisco Melo Lederman (Universidad Católica de Chile, Chile)

Gabriela Amodeo (Universidad de Buenos Aires, Argentina)

Simposio 1: Dinámica y función I.

Claudio Narambuena (Universidad de San Luis, Argentina)

Vitor Leite (Universidad de San Pablo, Brasil)

Nacho Sánchez (Universidad de Buenos Aires, Argentina)

Dante R. Chialvo (Universidad de San Martín, Argentina)

Simposio 2: Dinámica y función II.

Luciana Bruno (Universidad de Buenos Aires, Argentina)

Gerardo Ferrer-Sueta (Universidad de la República, Uruguay)

Javier Santos (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Argentina)

Rodrigo Diaz Espinoza (Universidad de Chile, Chile)

Simposio 3: Biofísica del Dengue y Zika.

Adolfo H. de Moraes (Universidad Federal de Minas Gerais, Brasil)

Jeremias Incicco (Universidad de Buenos Aires, Argentina)

Matias Machado (Instituto Pasteur - Montevideo, Uruguay)

Leila Cababie (Universidad de Buenos Aires, Argentina)

Simposio 4: Jóvenes científicos.

Pablo Galaz-Davison (Chile)

Rodrigo Cossio Perez (Argentina)

Felipe VIllanelo (Chile)

Exequiel Medina (Chile)

Joaquín Dalla Rizza (Uruguay)

Diego Quiroga Roger (Chile)

Andrea Poch Plá (Chile)

Matheus Ferraz (Brasil)

Simposio 5: Estructura y dinámica.

Rodolfo Rasia (Instituto de Biologia Molecular y Celular de Rosario, Argentina).

Fabio Almeida (Universidad Federal de Rio de Janeiro, Brasil)

Clara Smal (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Argentina)

Alejandro Buschiazzo (Instituto Pasteur - Montevideo, Uruguay)

Talleres

Measurement of protein relaxation using nuclear spin relaxation : theoretical and practical view Fabio C. L. Almeida – Federal University of Rio de Janeiro/ Adolfo Moraes – Federal University of Minas Gerais

The purpose of the course is to briefly introduce the theory nuclear spin relaxation and describe how the relaxation parameters can be used to obtain quantitative information on protein dynamics in a large range of timescales, from mili- to picoseconds. We will provide theoretic and a demonstrative practice of the Lipari-Szabo model free formalism, which provide information the the thermal dynamics (nano to picoseconds) and on CPMG relaxation dispersion (milli to microseconds). *You may carry with you your personal computer. We will provide a VMWARE virtual linux machine with all the relaxation practices that we will demonstrate in the classroom. Please install VMWARE player (windows) or VMWARE fusion (Mac).

1- Introduction to nuclear spin relaxation (~30min). Longitudinal and Transverse relaxation times. Secular and non-secular contribution to relaxation. Spectral density function/Correlation function. 2- Lipari Szabo model free formalism (LZMF) (~40min). Pulse sequences. Constructing a spectral density function to describe overall and internal motion. Isotropic and anisotropic motion. Applications. 3- Practical demonstration of LZMF using software Tensor 2. 4- CMPG relaxation dispersion. Chemical and conformational exchange. McConnell equation. 5-Practical demonstration of CMPG relaxation dispersion.

Computational Workshop: Reconstrucción de secuencias ancestrales. César Ramirez (PUC-Chile)

La reconstrucción de secuencias ancestrales es un método estadístico que permite inferir secuencias de proteínas primitivas a partir de las secuencias actuales. En este mini-curso introduciremos algunos aspectos prácticos del proceso de reconstrucción. Iniciaremos con algunos ejemplos tomados de la literatura para ilustrar el tipo de preguntas que pueden abordarse mediante esta metodología. Luego revisaremos las distintas etapas del método: recolección de secuencias, alineamiento múltiple, construcción de la filogenia y reconstrucción de la secuencia ancestral. Haremos hincapié en los distintos métodos de construcción de filogenias, y en los principales factores a tener en cuenta en esta etapa (selección del modelo evolutivo, criterios de confianza, etc). Los conceptos expuestos por los instructores serán complementados con ejercitación práctica, realizando los cálculos de cada etapa con software disponible públicamente.

Programa 1) Introducción. Reconstrucción de proteínas ancestrales para el estudio de la evolución molecular y la ingeniería de proteínas: algunos ejemplos. 2) Selección del grupo de estudio, consideraciones para la recolección de secuencias con adecuado muestreo de la familia de proteínas.3) Alineamiento múltiple de secuencias. Métodos automáticos, optimización manual.4) Construcción de filogenias. Métodos basados en distancia, parsimonia y máxima verosimilitud. Modelos de evolución. Raíz del árbol filogenético. Respaldo estadístico del árbol. Práctica: construcción de una filogenia mediante el método Bayesian Markov chain Monte Carlo (BMCMC) usando el programa MrBayes. 5) Reconstrucción de secuencias ancestrales. Método de máxima verosimilitud. Práctica: uso del programa PAML.

Posters (en Laptop): La presentación y discusión de los trabajos se realizará formalmente el día 21 de 9 a 12hs. Cada participante es responsable de llevar el/los artículos necesarios para presentar (laptop / tablet / telefono? / diapositivas impresas!). Contáctenos si necesita ayuda para que le proveamos.

Sala de conferencias: Aula Magna, pabellón I, Ciudad Univ.

Formulario de inscripción

Becas PABMB. Para aplicar a la ayuda financiera, los postulantes deben adjuntar al formulario de inscripción un resumen del trabajo a presentar y las razones por las cuales se solicita el financiamiento.

Posters: las presentaciones de trabajos se realizarán en formato digital (sin imprimir el poster). Los trabajos deben ser depositados en F1000 research, en formato poster o slides.

fecha límite becas PABMB: 20 de Marzo, 2017 (si, ya pasó)

fecha límite de inscripción : 18 de Abril, 2017

Cómo presentar mi póster?

Ud puede elegir presentar su trabajo como póster o como diapositivas. Debe ingresar al sitio F1000 research . Ahí encontará el formato específico y las instrucciones para subir su trabajo. IMPORTANTE: en el formulario de subida del trabajo, en el campo de Información Adicional, incluir PBATEOTW como palabra clave (así los otros participantes pueden encontrarlo fácilmente), ejemplo:

La presentación y discusión de los trabajos se realizará formalmente el día 21 de 9 a 12hs. Cada participante es responsable de llevar el/los artículos necesarios para presentar (laptop / tablet / telefono? / diapositivas impresas!). Contáctenos si necesita ayuda para que le proveamos.

organizadores: Ernesto A. Roman, Diego U. Ferreiro, César Ramirez-Sarmiento, Christian Wilson

contacto: ernest.roman@gmail.com