El 3 de julio de 2008, la Universidad Nacional Autónoma de México, a través de la Facultad de Estudios Profesionales Acatlán y del Seminario Permanente de Paleografía y Diplomática, firmó un convenio de colaboración académica con el Archivo Histórico del Colegio de San Ignacio de Loyola, Vizcaínas, en el cual se establecieron las bases para llevar a cabo diversas actvidades de complementación y colaboración académica, de acuerdo con sus facultades y recursos. En virtud de dicho convenio, las partes establecieron los programas de Investigación Histórica, Servicio Social y Prácticas Profesionales, Organización de Eventos Académicos y Coedición de Productos de Investigación.