Métodos Estadísticos Avanzados en Ecología y Evolución

Este es un curso intensivo opcional de la Maestría en Ciencias Biológicas, subárea Ecología y Evolución (Pedeciba- Facultad de Ciencias) que se ha dictado en formato de "Escuela de Verano" en Maldonado, Uruguay desde 2016.  

El programa actual del curso se encuentra aquí  y más abajo están los links a los archivos y videos asociados a cada clase.

Este curso ha sido tomado por más de 200 estudiantes de postgrado de Uruguay, Argentina, Brasil, Chile, Perú, Venezuela, España, Colombia, Ecuador,  Paraguay, El Salvador y México.

Tema 1: Modelo Lineal General. 

Teórico1: Introducción al modelo lineal general, regresión simple y múltiple; análisis de     residuales   video 

Teórico2: Análisis de varianza de uno y dos factores, tests a posteriori, análisis de covarianza.  video 

Práctico1: Regresión  simple y múltiple. scriptPr1,datosPr1.1, datosPr1.2, video

Práctico2: Análisis  de varianza de uno y dos factores, análisis de covarianza.  scriptPr2, datosPr2  video

Tema 2: Modelación Estadística 

Teórico3: Breve historia de la inferencia estadística; bases conceptuales de la estadística bayesiana, principales diferencias entre la estadística frecuentista y bayesiana; método de ximo de verosimilitud; selección de modelos usando el AIC: uso y abuso. video

Tema 3: Modelo Lineal Generalizado (GLM)

Teórico4: partes de un  GLM: componente aleatorio, predictor lineal y función de enlace; ajuste de los GLM; GLM de conteos; sobredispersión: causas, consecuencias y soluciones; ajuste e interpretación de parámetros estimados. video

Teórico5: uso del offset para incluir heterogeneidad de esfuerzo o susceptibilidad; GLM para proporciones; GLM con distr. Gama y Tweedie; ajuste e interpretación de parámetros estimados. video

Teórico6: GLM para datos binarios; conceptos de odds y logit; curvas ROC y AUC; Ajuste e interpretación de parámetros estimados. Modelos de mezcla para conteos con "exceso de ceros". video

Práctico3:  GLM de conteos; sobredispersión. scriptPr3datosPr3.1, datosPr3.2 video

Práctico4: GLM de proporciones; GLM de valores reales positivos.  scriptPr4, datosPr4.1, datosPr4.2 video

Práctico 5: GLM de datos binarios: GLM deconetos con "exceso" de ceros.  scriptPr5, datosPr5.1, datosPr5.2 video

Tema 4: Modelo Lineal Generalizado Mixto (GLMM)

Teórico7:  introducción a los modelos mixtos; efectos fijos y aleatorios, modelo lineal mixto: interceptos y pendientes aleatorias; ajuste e interpretación de los parámetros. video

Teórico8: significancia estadística y selección de modelos mixtos: controversias y soluciones: correcciones de Satterwhaite, Kenward-Roger y bootstrap paramétrico; introducción a los modelos lineales generalizados mixtos. video

Teórico9: bases del diseño experimental; principales tipos de diseño experimental usados en Ecología y Ciencias Ambientales: factorial, diseño en bloques, split-plot (parcelas divididas); crossover design, medidas repetidas, anidados; uso de los efectos aleatorios para incorporar el diseño experimental en el análisis de los datos.  video

Práctico7: dos ejemplos de modelos lineales mixtos scriptPr7, datosPr7.1, datosPr7.2 video

Práctico8: ejemplos de modelos lineales generalizados mixtos scriptPr8, datosPr8.1, datosPr8.2, video1 video2

Práctico9: más ejemplos de modelos lineales generalizados mixtos scriptPr9, datosPr9.1, datosPr9.2 video

Práctico10:  determinación del tamaño minimo de muestra: potencia y magnitud de efecto. Estimación de la potencia y el tamaño de muestra en GLMM usando simulaciones: desafíos y soluciones scriptPr10 video

Tema 5: Modelo Aditivo Generalizado (GAM) y otros

Teórico10: bases conceptuales y componentes de los modelos aditivos generalizados; funciones de suavizado; ajuste de los GAM; árboles de regresión y clasificación (CART): bases conceptuales, ajuste e interpretación. video 

Práctico11: dos ejemplos de GAMs; ejemplo de CART; regresiones multinomiales: ajuste e interpretación scriptPr11, datosPr11.1, datosPr11.2, datosPr11.3 video