Simulaciones de árboles de Bienaymé-Galton-Watson unitipo. Estos sirven para modelar la evolución de una población cuyos individuos se reproducen con las mismas características. En la segunda imagen, el color denota la distancia del vértice a la raíz.
Simulaciones del proceso de ramificación de un árbol Bienaymé-Galton-Watson. Este proceso codifica el tamaño de la población en cada generación.
Simulaciones de árboles de Bienaymé-Galton-Watson multitipo. Sirven para modelar poblaciones con subespecies diferenciadas.
Aquí encontrarás un código en R que simula una población con d subespecies compitiendo entre sí. El código se ejecuta en Google Colab, por lo que no es necesario instalar algún software en tu computadora. En las imágenes se muestran ejemplos de la evolución de dicha población, que está motivada en la especie de lagartijas 'Uta stansburiana', que vive en la región norte de México. En el artículo 'Uta stansburiana: una ventana a la evolución de las estrategias reproductivas', Vera-Ramírez, N., Martínez-Martínez, A., and Bojórquez Rangel, G. (2012), Acta Universitaria, 22(8), 5–11., se puede encontrar más información sobre dichas lagartijas.
La primera fila muestra la proporción acumulada de individuos en cada especie. La segunda fila muestra dos modelos límite de la población conforme el tamaño de ésta crece a infinito, uno como un sistema de ecuaciones diferenciales ordinarias y otro como un sistema de ecuaciones diferenciales estocásticas.
Las siguientes animaciones, muestran las transiciones en el proceso de Aldous-Broder y el proceso 'root-growth with re-grafting'. El proceso de Aldous-Broder se construye mediante una caminata aleatoria en una gráfica y borrando los ciclos formados, abteniendo así un árbol. El límmite de escala de éste, es el proceso root-growth with re-grafting. Algoritmos similares ha sido utilizados para la estimación de árboles filogenéticos.
Las siguientes animaciones, muestran el algoritmo de Wilson en el toro tres-dimensional. Este proceso contruye de manera eficiente un 'uniform spanning tree'.