Семена у голосеменных растений развиваются из семязачатков, расположенных в шишках. Семязачаток состоит из мегаспорангия (нуцеллуса), окружённого одним или двумя интегументами.  Внутри мегаспорангия развивается одна мегаспора, которая в результате деления образует четыре гаплоидные клетки. Три из этих клеток погибают, а одна развивается в женский гаметофит - эндосперм. Гаметофит содержит два или более яйцеклеток.