聖マーガレット教会は、札幌駅の南西約5キロに位置する山鼻地区にあります。藻岩山の山麓にあたり、病院や学校、様々な社会福祉施設が点在する住宅地となっています。この地域に1950年、札幌聖公会の南地域における伝道所が個人宅にて発足。やがて近隣に主教邸とマーガレット女子寮が設立され、その礼拝堂が聖マーガレット教会の母体となりました。3年後の2027年に、創立70年を迎えます。現在の堅信受領者は約50名。主日礼拝を約20名の信徒で守っています。