1992年 ナカタ・ケンコ氏、来日

1998年5月 開校

2001年2月 ブラジル政府の公認を受ける

2008年12月 地域支援グループ「さざなみ」によるクリスマス会開催（以後、毎年開催）

2012年4月～ 外国籍住民自立就労協会による虹教室をサンタナ学園で開始（国際移住機関委託事業）

2013年11月 ナカタ・ケンコ氏、社会貢献の功績を評価され社会貢献支援財団から受賞（詳しくはこちら）

2017年8月 NPO法人コレジオ・サンタナ設立認証

2019年10月 幼保無償化制度開始、対象となる