En el arco, según el manga, de "Versus Momoshiki", que abarca desde el capitulo 1 hasta el capitulo 10, trata sobre la llegada de Momoshiki Otsutsuki y Kinshiki Otsutsuki interrumpiendo los exámenes chunin que se estaban llevando a cabo en Konoha (Aldea Oculta de la Hoja). Durante el enfrentamiento entre Naruto y los Otsutsuki, este es derrotado y secuestrado para extraer el chacra de poseía dentro (Chacra del Zorro de las Nueve Colas). Sin embargo, Boruto se aventura junto con Sasuke Uchiha y los demás Kages para rescatar a Naruto. En este enfrentamiento los Kages hicieron su mayor esfuerzo, pero no pudieron hacer mucho frente al poder de los Otsutsuki, entonces es cuando Naruto y Sasuke muestran su verdadero poder y logran debilitarlo. Sin embargo, Momoshiki absorve el chacra de los jutsus lanzados, a través de las herramientas ninja, por Hatasuke Tono (Creador de las Herramientas Científicas Ninja) devolviendo su poder.

Finalmente, Naruto le presta poder a Boruto para formar un Rasengan con el que derrotaría a Momoshiki. Este, antes de ser derrotado, se introduce en la mente de Boruto donde es marcado por un Sello Divino que daría indicios e inicios a los nuevos poderes de las nuevas generaciones de Ninjas.