書籍（抜粋）
STOP鳥獣害～地域で取り組む対策のヒント （分担執筆）：農林統計出版，2014年
農作物を守る鳥獣害対策（分担執筆）：誠文堂新光社，2018年
実践 野生動物管理学 （分担執筆）：培風館，2021年
これからの地域社会のための獣害対策（単著）：農林統計協会，2022年
原著論文（抜粋）
山端直人、室山泰幸、鈴木克哉 (2012)：集落ぐるみのサル追い払い実施集落の住民活力に関する考察 農村計画学会誌．31，383－338
佐藤正衛、竹内正彦、山端直人、平田滋樹 (2015)：野生動物捕獲に関する技術体系の構築と獣害対策への活用 関東東海北陸農業経営研究，107，55-62
本田 剛、山端直人 (2017)：何故獣害は対策技術で解決されないのか -技術普及過程論による検証 ，野生生物と社会，5-2，17-23
山端直人、九鬼康隆、星野 敏 (2017)：獣害対策の継続が集落のソーシャルキャピタルに及ぼす効果 ，農村計画学会誌，34，369-366
飯場聡子、山端直人 (2017)：認定農業者における法人化の意向と経営管理能力に関する考察－三重県の認定農業者を対象に－，農業経営研究，108，17-24
山端直人、飯場聡子、鬼頭敦史 (2017)：集落アンケートを用いた鳥獣被害金額算出方法の検討，農村計画学会誌36, 363-368
山端直人、飯場聡子、鬼頭敦史 (2018) ：獣害対策技術の経営的評価－三重県伊賀市での実証的研究の結果から－ ，農業経営研究，56(4), 65-70
辻 大和、鈴木 克哉、清野 紘典、山端直人 、滝口 正明、葦田 恵美子、大井 徹、宇野 壮春 、大谷 洋介、江成 広斗、海老原 寛 、小金澤 正昭 (2018)：野生ニホンザルが加害する農作物・林産物，霊長類研究，34（2）， 153-159，2018
清野 紘典、山端直人 、 加藤 洋 、海老原 寛 、檀上 理沙 、 藏元 武藏 (2018)：ニホンザル加害群を対象とした計画的な個体群管理の有効性，霊長類研究 34(2), 141-147, 2018
山端直人、六波羅総、清野宏典、鬼頭敦史 (2018)：三重県におけるニホンザル被害管理と個体数管理の現状と課題，霊長類研究 34(2), 133-140
飯場聡子、山端直人 (2018)：農業就業体験を通じた育児期女性の農業就業の可能性 ―三重県における農業就業体験参加者の事例分析より－，農村生活学会誌，62，2，44-52
Takeshi Honda1，Naoto Yamabata，Hayato Iijima，Kenta Uchida (2019):Sensitization to human decreases human-wildlife conflict:empiricaland simulation study, European Journal of Wildlife Research volume 65, Article number: 71
Tsutomu TAKEDA1, Hiromi FUJITA, Masumi IWASAKI, Moe KASAI,，Nanako TATORI, Tomohiko ENDO, Yuuji KODERA1,Naoto YAMABATA (2019)：Positive rates of anti-acari-borne disease antibodies of rural inhabitants in Japan，Journal of Veterinary Medical Science，81（5）,758-763
中村大輔、佐藤正衛、平田滋樹、山端直人、竹内正彦 (2019)： 野生獣類捕獲わなにおけるICT利用の費用対効果，農業経営研究，57(2), 83-88, 2019
山端直人、飯場聡子 (2019)：サル管理の進展に伴う集落住民の感情変化- 集落住民へのグループインタビューによる住民感情の分析- ，農村計画学会誌38，215-220
Wanyi Lee,Takashi Hayakawa,Mieko Kiyono,Naoto Yamabata,Goro Hanya (2019):Gut microbiota composition ofJapanese macaques ssociates with extent ofhuman encroachment ,American Journal of Primatology81
山端直人、飯場聡子 (2020)：捕獲個体利活用施設の経営収支 - 2タイプの比較- ，農業経営学会誌57(4), 61-67
飯場聡子、山端直人 (2021)：農業就業体験が就農希望学生の就農・就職意識に与える影響，農村生活研究，64，2，40-47
山端直人、池田恭介、飯場聡子 (2021)：「獣害に強い集落づくり」支援における県の体制比較－５県の比較による考察―，農村計画学会論文集 1 (1), 1-7
その他論文等（抜粋）
山端直人(2015)：獣害と農村のマネジメント ，農村計画学会誌，34，357-360
山端直人、鈴木克也 (2013)：通電式支柱「おじろ用心棒」を用いた電気柵に対するニホンザルの行動変化， 兵庫ワイルドライフモノグラフ，5，81-87
山端直人(2016)：サルの被害管理と個体数管理の考え方，ATAFFジャーナル，2，11，13－18
山端直人、高木俊、栗山武夫 (2018)：鳥獣害アンケートから見たシカによる農業被害と対策の関係性，兵庫ワイルドライフモノグラフ，9，86-96
山端直人 (2017)：地域社会のための総合的な獣害対策とその実践 : 被害防除・個体数管理・集落支援・関係機関の体制づくり ，農耕と園芸 73(12), 12-17, 2018-12
山端直人 (2018)：地域社会のための総合的な獣害対策とその実践 : 被害防除・個体数管理・集落支援・関係機関の体制，国際文化研修 26(3), 34-39, 2019
山端直人、森光由樹 (2021)：兵庫県のニホンザルによる農業被害とその対策の群れ間比較，兵庫ワイルドライフモノグラフ13．28-43
山端直人 (2021)：これからの地域社会のための獣害対策 ，農業，1677号，26-39
山端直人（2021）：地域主体のニホンザル管理 ，National parks ,799, 13-16