El 25 de Noviembre de 1999, se inauguró el Museo del Desierto de Coahuila con la presencia del Presidente de la República Dr. Ernesto Zedillo Ponce de León y los Consejeros Directores de la Fundación Amigos del Desierto de Coahuila.
El Museo del Desierto es un proyecto cuya misión es fomentar una cultura ecológica de valoración y respeto del desierto al mostrar la riqueza de vida, historia y cultura que en él se han gestado. Este fue construido y es operado por la fundación Amigos del Desierto de Coahuila, A. C. Cuenta con una superficie de más de 10 hectáreas y tuvo, en su inicio, un costo de aproximadamente 120 millones de pesos provenientes de la participación del Gobierno del Estado de Coahuila y donativos del Gobierno Federal y empresas privadas, así como un número considerable de ciudadanos que donaron sus colecciones.
Las empresas donadoras son: Daimler-Chrysler de México, Industrias Peñoles, Altos Hornos de México, Grupo Domos, Grupo VITRO, Teksid-Quimmco, Universidad Autónoma de Coahuila, Monolite, Grupo Industrial Saltillo, CEMEX, Cementos APASCO, Embotelladora del Carmen, Grupo Libra, así como también alrededor de mil ciudadanos coahuilenses que, cada uno en la medida de sus posibilidades, aportaron donativos que se aplicaron en la realización de este proyecto.
Este Museo que inició su conceptualización hace más de 15 años, al conocerse los primeros hallazgos paleontológicos en la entidad, significó el esfuerzo y dedicación de un importante grupo de especialistas en las áreas de paleontología, geología, historia, biología, arqueología, antropología y museografía, todos ellos coordinados por el Instituto Coahuilense de Cultura, quienes desarrollaron los guiones científicos, museográficos y museológicos con los que fue posible la concreción de este proyecto. Hoy el Museo del Desierto es una realidad gracias a la decidida participación de empresas y dependencias del Gobierno del Estado de Coahuila que forman su consejo de directores.
Además de las aportaciones económicas y en especie antes mencionadas, el Museo del Desierto cuenta con una riqueza invaluable que se encuentra en cada una de las piezas de exposición en los cuatro pabellones. Es para el Museo un honor albergar en él, objetos que antes guardaban celosamente instituciones y particulares como: Grupo Minar, Micare, Claudio S. De León, Industrial Minera México, José Flores Venturas, Peñoles Química del Rey, Daniel Posada Martínez, Ferrocarriles Nacionales de México, Luis Horacio Salinas Aguilera, PROFEPA, Pedro Fuentes y las familias Morales Arzuaga, Gutiérrez Arzuaga y Arzuaga Osuna, entre otras.
Importante es destacar la colaboración de diversas instituciones nacionales e internacionales especializadas en diferentes temas afines al Museo: como la British Broadcast Company, el Instituto Nacional de Antropología e Historia, el Natural History Exhibit Hall, la NHK Televisión Japonesa, el Instituto de Tecnología de la UNAM, el Denver Museum of Natural History, MVS Multivisión y otras muchas instituciones.