池田 宗樹

職歴 [Neurotree]

• 2023.10–現在: 日本学術振興会 特別研究員(CPD), 東京大学大学院 総合文化研究科 (大泉匡史 研究室) 

• 2023.04–2023.09: 日本学術振興会 特別研究員(PD), 東京大学大学院 総合文化研究科 (大泉匡史 研究室) 

• 2021.04–2023.03: 日本学術振興会 海外特別研究員, カリフォルニア大学サンフランシスコ校 神経科 (Saul Kato 研究室) 

• 2020.12–2024.02: 客員研究員, インディアナ大学ブルーミントン校  認知科学プログラム (Eduardo J Izquierdo 研究室)

• 2020.08–現在: 博士研究員, カリフォルニア大学サンフランシスコ校 神経科 (Saul Kato 研究室) 

• 2020.06–現在: 客員研究員, 理化学研究所 脳神経科学研究センター (村山正宜  研究室) 

• 2020.04–2020.07: 特任研究員, 東京大学大学院 総合文化研究科 (大泉匡史 研究室) 

• 2019.08–2020.03: 研究補助員, 理化学研究所 脳神経科学研究センター (村山正宜  研究室) 

• 2019.04–2020.03: 学術支援職員, 東京大学大学院 総合文化研究科 (大泉匡史 研究室) 

• 2016.04–2018.03: 日本学術振興会 特別研究員(DC2), 名古屋大学大学院 理学研究科 (森郁恵 研究室)

学歴 [Neurotree]

• 2015.04–2020.03 (博士): 名古屋大学大学院 理学研究科 生命理学専攻 (森郁恵 研究室) 

• 2013.04–2015.03 (修士): 東京大学大学院 総合文化研究科 広域科学専攻 生命環境科学系 (川戸佳 研究室)

• 2011.04–2013.03 (学士): 東京大学 教養学部 基礎科学科 生体機能分科 (川戸佳 研究室)

発表論文 [Google Scholar]

Journal Articles

1. Kamiya S, Mitamura T, Ikeda M, Oizumi M
   Unsupervised Neuronal Matching with Spontaneous Neuronal Activity.
   ICLR Re-Align Workshop, 64, 2025

2. Ota K, Oisi Y#, Suzuki T#, Ikeda M#, Ito Y#, Ito T#, Uwamori H, Kobayashi K, Kobayashi M, Odagawa M, Matsubara C, Kuroiwa Y, Horikoshi M, Matsushita J, Hioki H, Ohkura M, Nakai J, Oizumi M, Miyawaki A, Aonishi T, Ode T, Murayama M  (#Equal contribution)
   Fast, cell-resolution, contiguous-wide two-photon imaging to reveal functional network architectures across multi-modal cortical areas.
   Neuron, 109(11), 2021

3. Ikeda M, Matsumoto H, Izquierdo EJ
   Persistent thermal input controls steering behavior in Caenorhabditis elegans.
   PLoS Computational Biology, 17(1), 2021

4. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Xu L, Costa WS, Gottschalk A, Mori I
   Context-dependent operation of neural circuits underlies a navigation behavior in Caenorhabditis elegans.
   Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117(11), 2020

5. Nakano S, Ikeda M, Tsukada Y, Fei Z, Suzuki T, Ahluwalia R, Sano A, Kondo R, Ihara K, Hashimoto K, Higashiyama T, Mori I
   Presynaptic MAST kinase controls opposing postsynaptic responses to convey stimulus valence in Caenorhabditis elegans.
   Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117(3), 2020

6. Kitamura A, Hojo Y, Ikeda M, Karakawa S, Kuwahara T, Kim J, Soma M, Kawato S, Tsurugizawa T
   Ingested D-Aspartate Facilitates the Functional Connectivity and Modifies Dendritic Spine Morphology in Rat Hippocampus.
   Cerebral Cortex, 29(6), 2019

7. Yamaguchi S, Honda N, Ikeda M, Tsukada Y, Nakano S, Mori I, Ishii S
   Identification of animal behavioral strategies by inverse reinforcement learning.
   PLoS Computational Biology, 14(5), 2018

8. Hojo Y, Munetomo A, Mukai H, Ikeda M, Sato R, Hatanaka Y, Murakami G, Komatsuzaki Y, Kimoto T, Kawato S
   Estradiol rapidly modulates spinogenesis in hippocampal dentate gyrus: Involvement of kinase networks.
   Hormones and Behavior, 74, 2015

9. Ikeda M, Hojo Y, Komatsuzaki Y, Okamoto M, Kato A, Takeda T, Kawato S
   Hippocampal spine changes across the sleep–wake cycle: corticosterone and kinases.
   Journal of Endocrinology, 226(2), 2015
   [Society for Endocrinology Journal of Endocrinology Award  2016] 

10. Hasegawa Y, Hojo Y, Kojima H, Ikeda M, Hotta K, Sato R, Ooishi Y, Yoshiya M, Chung BC, Yamazaki T,  Kawato S
    Estradiol rapidly modulates synaptic plasticity of hippocampal neurons: Involvement of kinase networks.
    Brain Research, 1621, 2015

11. Hatanaka Y, Hojo Y, Mukai H, Murakami G, Komatsuzaki Y, Kim J, Ikeda M, Hiragushi A, Kimoto T, Kawato S
    Rapid increase of spines by dihydrotestosterone and testosterone in hippocampal neurons: Dependence on synaptic androgen receptor and kinase networks.
    Brain Research, 1621, 2015

12. Hasegawa Y, Mukai H, Asashima M, Hojo Y, Ikeda M, Komatsuzaki Y, Ooishi Y, Kawato S
    Acute modulation of synaptic plasticity of pyramidal neurons by Activin in adult hippocampus.
    Frontiers in Neural Circuits, 8(56), 2014

13. Yoshiya M, Komatsuzaki Y, Hojo Y, Ikeda M, Mukai H, Hatanaka Y, Murakami G, Kawata M, Kimoto T, Kawato S
    Corticosterone rapidly increases thorns of CA3 neurons via synaptic/extranuclear glucocorticoid receptor in rat hippocampus.
    Frontiers in Neural Circuits, 7(191), 2013

Preprints

1. Zhou K, Gu C, Ikeda M, Hayward TM, Nicholas Antipa, Menon R, Horstmeyer R, Kato S, Waller L
   Large-scale compressive microscopy via diffractive multiplexing across a sensor array.
   arXiv, 2507.14437, 2025

2. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Costa WS, Gottschalk A, Mori I
   Circuit Degeneracy Facilitates Robustness and Flexibility of Navigation Behavior in C.elegans.
   bioRxiv, 385468, 2018

学会発表

口頭発表

1. Ikeda M
   Breaking microscopy trade-offs toward pan-neuronal recording in freely moving animals.
   UC Merced CIN Seminar, Merced, March 2025

2. Ikeda M
   If IIT is pseudo-science, how can the study of consciousness be scientific?
   UC Merced Philosophy Seminar, Merced, March 2025

3. Ikeda M
   線虫C. elegansにおける機能的神経回路の抽出とその理解
   Japanese San Francisco Bay Area Seminar, Online, 2021年10月

4. Ikeda M
   Consciousness research in C. elegans.
   線虫研究の未来を創る会, Online, 2021年9月

5. Honda N, Ikeda M
   動物の行動戦略を解読する逆強化学習と線虫行動への応用
   定量生物学の会 第九回年会, 吹田, 2019年1月

6. Ikeda M
   線虫C. elegansにおける機能的神経回路の抽出と統合情報量解析
   平成29年度 生理学研究所研究会, 岡崎, 2017年9月

7. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
   How to build a realistic circuit model in C. elegans.
   第5回 神経回路合同研究会, 名古屋, 2017年9月

8. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
   Information Flow through Local Neural Circuits that Integrate Sensory Input and Behavioral Output during a C. elegans Navigation Behavior.
   第40回 日本神経科学大会, 千葉, 2017年7月

9. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
   Local neural circuits integrating sensory input and behavioral output during a C. elegans navigation behavior
   第4回 神経回路合同研究会, 名古屋, 2016年10月

10. Ikeda M, Kawato S
    海馬神経シナプスに及ぼすストレスホルモンの効果
    第2回日本生物物理学会関東支部会, 東京, 2013年3月

主要なポスター発表

1. Ikeda M, Chen W, Kato S, Nakano S, Honda N
   Decoding internal models and dynamics of curiosity using the inverse free energy principle
   25th International C. elegans Conference, Davis, July 2025

2. Ikeda M, Matsuda T, Kato S, Izquierdo EJ
   Modeling neural circuits for multi-task behavior in C. elegans thermotaxis.
   C. elegans Topic Meeting: Neuronal Development, Synaptic Function & Behavior, Madison, Jun 2024

3. Ikeda M, Chen Y, Pitkow X, Kato S
   C. elegans effort-versus-reward studies enabled by a novel microfluidic arena
   24th International C. elegans Conference, Glasgow, 2023年6月

4. Ikeda M, Kitazono J, Oizumi M, Kato S
   Integrated information assesses the level of consciousness in C. elegans.
   C. elegans Topic Meeting: Neuronal Development, Synaptic Function & Behavior, Vienna, 2022年7月

5. Ikeda M, Matsumoto H, Izquierdo EJ
   Klinokinetic steering strategy implemented in a neuroanatomical model for C. elegans thermotaxis.
   第44回 日本神経科学大会, Online, 2021年7月

6. Ikeda M, Matsumoto H, Izquierdo EJ
   Klinotactic versus klinokinetic steering strategies implemented in neuroanatomical models for C. elegans thermotaxis.
   23rd International C. elegans Conference, Online, 2021年6月

7. Matsumoto H, Ikeda M
   Embedding neuronal dynamics to connect neuronal activity to behavioral patterns.
   日本バイオインフォマティクス学会 2019年年会, 東京, 2019年9月

8. Ikeda M, Izquierdo EJ, Oizumi M, Kitazono J, Mori I
   Integrated Information Predicts the Performance of Neuroanatomical Models of the Nematode C. elegans.
   Second meeting of Consciousness Research Network, 岡崎, 2019年1月 

9. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
   光駆動型細胞死誘導タンパク質miniSOGを用いた機能的神経回路の同定
   第9回 光操作研究会, 仙台, 2017年10月

10. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
    Identification and analysis of multifunctional neurons in a C. elegans thermotaxis behavior.
    21st International C. elegans Conference, Los Angeles, 2017年6月

11. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
    Identification of behavior elements during thermotaxis behavior in the nematode Caenorhabditis elegans.
    C. elegans Topic Meeting: Neuronal Development, Synaptic Function & Behavior, 名古屋, 2016年7月

12. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
    Local Neural Circuits Integrating Sensory Input and Behavioral Output during a C. elegans Navigation Behavior.
    第39回 日本神経科学大会, 横浜, 2016年7月

13. Ikeda M, Nakano S, Giles AC, Mori I
    Regulation of behavior elements for thermotaxis in the nematode Caenorhabditis elegans.
    Neocortical Organization III, 東京, 2016年3月

14. Ikeda M, Hojo Y, Komatsuzaki Y, Okamoto M, Kato A, Kawato S
    Hippocampal spine density changes depending on corticosterone levels along the sleep-wake cycle.
    第38回 日本神経科学大会, 神戸, 2015年7月

15. Ikeda M, Komatsuzaki Y, Yoshiya M, Hojo Y, Kawato S
    Correlation between circadian rhythm of corticosterone and synapse in the hippocampus.
    第37回 日本神経科学大会, 横浜, 2014年9月

研究費

• 2025.01–2026.12: KIFN Kavli's Collaboration Grant (co-applicant)

• 2024.04–2026.03: 日本学術振興会 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A) (公募研究)

• 2023.10–2028.03: 日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(CPD)

• 2023.04–2023.09: 日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(PD)

• 2016.04–2018.03: 日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(DC2)

賞

• 2022.03: NIKON JOICO AWARD 最優秀JOICO賞

• 2021.09: 線虫研究の未来を創る会 ネクストリーダー賞

• 2018.01: 平成29年度 IGER年次報告会 ポスター賞

• 2017.01 平成28年度 IGER年次報告会 ポスター賞

• 2016.11: Society for Endocrinology Journal of Endocrinology Award

• 2015.03: 東京大学大学院 総合文化研究科 広域科学専攻 奨励賞