ไม่ทราบว่าผู้ใดเป็นผู้สร้าง และสร้างขึ้นเมื่อใด เมื่อพ.ศ. 2535 กองโบราณคดี กรมศิลปากร ได้มาสำรวจโบราณสถานวัดมหาโพธิใต้ กำหนออายุการสร้างในสมัยสุโขทัย และกรุงศรีอยุธยา อายุ กว่า 300ปี
อุโบสถ เป็นอาคารเครื่องก่อขนาด 4 ห้อง พบมากที่ จ.สุโขทัยและพิษณุโลก ศิลปะอยุธยาตอนต้น หน้าบันเป็นรูปเทพชุมนุม แผงแรคอสองเป็นรูปยักษ์ท้าวเวสสุวัณ สิงห์ สิงโตจีน เป็นที่มาของตำราใบลานสมัยอยุธยา สิงห์ เสือ คชสิงห์ สัตว์หิมพานต์ ประติมากรรมเขียนสีสกุลช่างพื้นบ้านที่งดงาม
เสมา หินชนวนจำหลัก ลวดลายเครือวัลย์ และดอกไม้ศิปละสุโขทัยต่อถึงอยุธยาตอนต้น คล้ายเสมาวัดจุฬามณี จ.พิษณุโลก ( สร้างพ.ศ.2007 ) และวัดพระศรีสรรเพชร์ จ.อยุธยา มีคณะทำวิจัยเสมา บันทึกว่าเสมาโบสถ์วัดมหาโพธิใต้นี้ มีสัดส่วนลวดลายงดงามและสมบูรณ์ที่สุดในภาคกลางและภาคเหนือ
ศาลาการเปรียญ เดิมเป็นศาลา 2 หลัง เชื่อมติดต่อกันหลังประธานสร้างประมาณ พ.ศ.2418 มีเสาไม้กลมใหญ่ทั้งหมด ใช้สลักไม้และสังฆวานร ฝีมือช่างโบราณมุงกระเบื้อง เกล็ดเต่าดินเผาไม่เคลือบ เพดานจิตกรรมเป็นลายดวงดารา ลายดอกไม้ ที่ขื่อลายดาวประจำยาม ดาวจงกล ฝีมือช่างพื้นบ้านมีลักษณะงดงามมาก เล่ากันต่อมาว่า ลวดลายเพดานหลวงพ่อเฮงสมัยเป็นเณรได้ร่วมช่วยวาดด้วย กรมศิลปากรชื่มชนศาลาหลังนี้ว่าเป็นอาคารไม้ที่มีลักษณะรูปทรงและสัดส่วนที่งดงามมาก