Lãnh đạo hiện nay
Đại tá, Thạc sĩ Lê Vũ Huy - Giám đốc, Bí thư Đảng uỷ Bảo tàng Lịch sử Quân sự Việt Nam
Đại tá, Thạc sĩ Đinh Xuân Hòa - Phó Giám đốc Bảo tàng
Thượng tá, Thạc sĩ Nguyễn Thành Lê - Phó Giám đốc Bảo tàng
Thượng tá, Thạc sĩ Nguyễn Tiến Dũng - Phó Giám đốc Bảo tàng
Tổ chức
Phòng Hành chính - Tổng hợp
Phòng Sưu tầm
Phòng Kiểm kê - Bảo quản
Phòng Trưng bày - Triển lãm
Phòng Tuyên truyền - Giáo dục
Phòng Hướng dẫn nghiệp vụ
Ban Thông tin - Tư liệu - Thư viện
Ban Tài chính