Il Nucleoide, è una regione dalla forma irregolare all'interno della cellula procariote, che contiene materiale genetico costituito da DNA circolare a doppio filamento, di cui possono esistere copie multiple.

Esso contiene anche un'associazione di proteine, di cui solamente alcune note e che si stima siano almeno una dozzina. Queste proteine si complessano con il DNA genomico modulandone la trascrizione.