論文
プレプリント（査読無し）
Kumata R and Inada T. (2023) When Does Resource Allocation to New Technologies by Incumbent Firms Lead to Their Survival? Formal Model Analysis SSRN version
英文誌（査読有）
Konno Y, Uriu K, ..., Kumata R, ..., Kei Sato. (2024) Two-step evolution of HIV-1 budding system leading to pandemic in the human population. Cell Reports
Kumata R and Sasaki A. (2022) Antigenic escape accelerated by the presence of immunocompromised hosts. Proceedings of the Royal Society B bioRxiv version
Kumata R, Iwanami S, Mar KB, Kakizoe Y, Misawa N, Nakaoka S, Koyanagi Y, Perelson AS, Schoggins JW, Iwami S, Sato K. (2022) Antithetic effect of interferon-α on cell-free and cell-to-cell HIV-1 infection. PLoS Computational Biology
Kumata R, Ito J, Takahashi K, Suzuki T, Sato K. (2020) A tissue level atlas of the healthy human virome. BMC Biology
Nakano Y, Yamamoto K, Takahashi Ueda M, Soper A, Konno Y, Kimura I, Uriu K, Kumata R, Aso H, Misawa N, Nagaoka S, Shimizu S, Mitsumune K, Kosugi Y, Juarez-Fernandez G, Ito J, Nakagawa S, Ikeda T, Koyanagi Y, Harris RS, Sato K. (2020) A role for gorilla APOBEC3G in shaping lentivirus evolution including transmission to humans. PLoS Pathogens
Kumata R, Ito J, Sato K. (2020) Inherited chromosomally integrated HHV-6 possibly modulates human gene expression. Virus Genes
Konno Y, Nagaoka S, Kimura I, Yamamoto K, Kagawa Y, Kumata R, Aso H, Takahashi Ueda M, Nakagawa S, Kobayashi T, Koyanagi Y, Sato K. (2018) New World feline APOBEC3 potently controls inter-genus lentiviral transmission. Retrovirology
Konno Y, Nagaoka S, Kimura I, Takahashi Ueda M, Kumata R, Ito J, Nakagawa S, Kobayashi T, Koyanagi Y, Sato K. (2018) A naturally occurring feline APOBEC3 variant that loses anti-lentiviral activity by lacking two amino acid residues. Journal of General Virology
その他
熊田隆一, 佐藤佳. 健常なヒト体内における"隠れた"ウイルス感染の網羅的同定. 実験医学, 羊土社, 38巻18号, pp. 3128-3131, 2020.（商業誌）
学会発表
国内学会
熊田隆一, 佐々木顕. 免疫不全患者存在下におけるウイルスの抗原変異ダイナミクス. 2022年 日本ウイルス学会 (2022年11月、長崎、ポスター)
熊田隆一, 佐々木顕. 免疫不全患者存在下でのウイルス抗原進化の促進. 2022年 日本数理生物学会年会 (2022年9月、オンライン、口頭発表)
熊田隆一, 佐々木顕. 寄生者が媒介する捕食抵抗性の進化とその個体群動態への影響. 日本生態学会第69回全国大会 (2022年3月、オンライン、ポスター)
熊田隆一, 佐藤正都, 佐々木顕. 新型コロナウイルスの潜伏期間の進化解析. 日本生態学会第68回全国大会 (2021年3月、オンライン、口頭発表)
熊田隆一, ヒト組織バイロームの網羅的解析. ウイルス学若手研究集会2020 (2020年12月、オンライン)
熊田隆一, 佐藤正都, 佐々木顕. 新型コロナウイルスの潜伏期間の進化解析. 2020年 日本数理生物学会年会 (2020年9月、オンライン、ポスター、ポスター賞受賞)
熊田隆一, 伊東潤平, 佐藤佳. バイオインフォマティクスによるヒト組織特異的バイローム（ウイルス叢）の包括的解析. 第42回日本分子生物学会年会 (2019年12月、福岡、ポスター)
Ryuichi Kumata, Jumpei Ito, Kei Sato. Comprehensive Investigation of tissue-specific human virome through transcriptomic analysis. 第67回日本ウイルス学会学術集会(2019年10月、東京、ポスター)
熊田隆一, 柿添友輔, 三沢尚子, 岩見真吾, 小柳義夫, 佐藤佳. HIV複製におけるインターフェロンの効果の定量化. 2019年 日本数理生物学会年会 (2019年9月、東京、ポスター)
熊田隆一, 柿添友輔, 三沢尚子, 岩見真吾, 小柳義夫, 佐藤佳. HIV-1 の2つの感染様式に作用する IFN-αの相反的効果. 第 16 回ウイルス学キャンプ, 湯河原, 2019 年 5 月 28 日. 口頭(査読無)
熊田隆一, 柿添友輔, 三沢尚子, 岩見真吾, 小柳義夫, 佐藤佳. The conflicting effects of IFN-α on two modes of HIV-1 infection. 第19回東京大学生命科学シンポジウム (2019年4月、東京、ポスター)
Ryuichi Kumata, Yusuke Kakizoe, Naoko Misawa, Shingo Iwami, Kei Sato, Yoshio Koyanagi. Quantification of antiviral effects of IFN-α on HIV cell-free and cell-to-cell infection based on experimental-mathematical investigation. 第 66 回日本ウイルス学会学術集会(京都 2018 年 10 月 29 日)口頭(査読有)
Ryuichi Kumata, Naoko Misawa, Narumi Saito, Yusuke Kakizoe, Shinji Nakaoka, Shingo Iwami, Kei Sato, Yoshio Koyanagi. Quantification of HIV cell-free and cell-to-cell infectious efficiency change by IFN-α based on experimental-mathematical investigations. 第 40 回日本分子生物学会年会 (神戸 2017 年 12 月) ポスター
国際学会
Kumata R, Ohtsuki H, Sasaki A. Evolutionary dynamics of virulence of helper and satellite viruses. 6th Workshop on Virus Dynamics (July 2023, Nagoya Japan) Poster
Kumata R, Sasaki A. The speed of antigenic escape in the presence of immunocompromised host. Evolution 2022. (June 2022, Virtual talk)
受賞
熊田隆一, 佐藤正都, 佐々木顕. 日本数理生物学会名古屋大会ポスター賞(2020) 新型コロナウイルスの潜伏期間の進化
プレスリリース
免疫不全宿主の存在がウイルスの免疫逃避を加速する 総合研究大学院大学プレスリリース
https://www.soken.ac.jp/news/2022/20221122.htmlヒト組織ヴァイローム（ウイルス叢）の網羅的描出－健常人の体内における"隠れた"ウイルス感染の様相－
https://www.ims.u-tokyo.ac.jp/imsut/jp/about/press/page_00008.html