ปีงบประมาณ 2520 อำเภอกระทุ่มแบนได้รับการอนุมัติจาก กระทรวงสาธารณสุขให้จัดสร้างโรงพยาบาลอำเภอขนาด 30 เตียงขึ้นบนที่ดิน ของนางสาวอุบล  ทองสิมา ตำบลตลาดกระทุ่มแบน จำนวน 25 ไร่  เปิดดำเนินการครั้งแรก วันที่ 23 กรกฎาคม พ.ศ. 2522 โดยมี นายแพทย์ชูวิทย์  ลิขิตยิ่งวรา   เป็นผู้อำนวยการโรงพยาบาลกระทุ่มแบนท่านแรก 

หลังจากโรงพยาบาลกระทุ่มแบนเปิดดำเนินการไม่นานมีผู้ป่วยเข้ามา รับบริการจำนวนมาก คณะกรรมการมูลนิธิโรงพยาบาลกระทุ่มแบนจึงมีมติให้ร่วมกับภาคประชาชน จัดงานวันรวมน้ำใจ หารายได้จัดสร้างตึกผู้ป่วยในเพิ่มอีก 1 หลัง ได้เงินบริจาคมากกว่า 1 ล้านบาท เข้าสมทบกับงบประมาณกระทรวงสาธารณสุข 1 ล้าน 5 แสนบาท  ก่อสร้างตึกผู้ป่วยใน 30 เตียง ใช้ชื่ออาคาร  “ตึกประชา - รัฐ” แล้วเสร็จและเปิดอย่างเป็นทางการ เมื่อเดือน กรกฎาคม พ.ศ. 2525

ปีพ.ศ. 2534 โรงพยาบาลกระทุ่มแบนได้รับบริจาค “อาคารตระกูล ระหงษ์ - มีรักษา”  โดยท่านพลอากาศเอกสมบุญ - คุณหญิงนงเยาว์ ระหงษ์ เป็นอาคารชั้นเดียว เปิดให้บริการเป็นตึกคลอดและผ่าตัด ประกอบด้วย ห้องคลอด 3 เตียง  ห้องรอคลอดและหลังการคลอด 12 เตียง และห้องผ่าตัด 2 ห้อง อาคารนี้  เปิดให้บริการ ตั้งแต่ พ.ศ.2535

ปีพ.ศ. 2539   นพ.วิทิต  อรรถเวชกุล  รักษาการผู้อำนวยการขณะนั้น ได้ขอสนับสนุน งบประมาณ จำนวน 42 ล้านบาท สร้างอาคาร ผู้ป่วยใน 5 ชั้น ใช้ชื่อว่าอาคารเฉลิมพระเกียรติ 6 รอบพระชนมพรรษา เปิดอาคารใช้ได้ในปีพ.ศ. 2542 

ปีพ.ศ. 2542  นพ.บุญชัย  ตั้งสง่าศักดิ์ศรี  ผู้อำนวยการโรงพยาบาล ได้รวบรวมเงินบริจาค และรายได้จากการจำหน่ายสลากการกุศล จำนวน 1 ล้านฉบับ งวดวันที่ 1 พฤศจิกายน พ.ศ. 2542  ซึ่ง นายวิเชียร  เปาอินทร์อดีตผู้ว่าราชการจังหวัด สมุทรสาคร เป็นประธานดำเนินการสมทบทุน สร้างอาคารเฉลิมพระเกียรติ 48 พรรษา “สธ” ใช้งบประมาณก่อสร้างทั้งสิ้น 61.4 ล้านบาท  เริ่มเปิดให้บริการ 23 กรกฎาคม พ.ศ. 2545 ทั้งนี้จากการที่โรงพยาบาลมีจำนวนเตียงที่เพิ่มขึ้นและพัฒนาศักยภาพอย่างต่อเนื่อง จึงได้รับการยกฐานะเป็นโรงพยาบาล ขนาด 120 เตียง วันที่ 18 มิถุนายน พ.ศ. 2544 

วันที่ 14 มกราคม พ.ศ. 2549 ประชาชนชาวอำเภอกระทุ่มแบน ได้มีโอกาสถวายการต้อนรับ พลเอกหญิง พลเรือเอกหญิง พลอากาศเอกหญิง สมเด็จพระกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา เจ้าฟ้ามหาจักรีสิรินธร มหาวชิราลงกรณวรราชภักดี สิริกิจการิณีพีรยพัฒน รัฐสีมาคุณากรปิยชาติ สยามบรมราชกุมารี เสด็จพระราชดำเนินเพื่อประกอบพิธีเปิดอาคารเฉลิมพระเกียรติ 6 รอบ พระชนมพรรษา  และอาคาร เฉลิมพระเกียรติ 48 พรรษา “สธ” ทรงพระราชดำรัสว่า "โรงพยาบาลกระทุ่มแบนอยู่ริมแม่น้ำท่าจีน มีทิวทัศน์ที่สวยงามมาก จะหาโอกาสกลับมาเยี่ยมอีก” 

วันที่ 9 ธันวาคม พ.ศ. 2549   โรงพยาบาลกระทุ่มแบนร่วมกับคณะกรรมการบริหารและพัฒนาโรงพยาบาลภาคประชาชน รวมถึง พ่อค้า ประชาชน ได้จัดกิจกรรม ผ้าป่าสามัคคีมหากุศลขึ้น เพื่อหารายได้ซื้อที่ดิน จำนวนพื้นที่ 1 ไร่ 1 งาน 98 ตารางวา เป็นเงิน 9,000,000 บาท ทำการถมดินปรับพื้นที่เพื่อทำเป็นลานจอดรถสำหรับผู้มารับบริการซึ่งแล้วเสร็จในปี พ.ศ. 2551

วันที่ 13 มิถุนายน พ.ศ. 2552 ฯพณฯ อภิสิทธิ์  เวชชาชีวะ  นายกรัฐมนตรีได้เดินทางมาเยี่ยมและเห็นชอบให้สร้างอาคารผู้ป่วยนอกและอุบัติเหตุ 5 ชั้น ปีงบประมาณ 2554 จึงได้รับการอนุมัติงบประมาณก่อสร้าง 167,598,000 บาท การก่อสร้างอาคารผู้ป่วยนอกและอุบัติเหตุ แล้วเสร็จ เมื่อปลายปีพ.ศ. 2557 แต่ยังไม่สามารถเปิดดำเนินการได้ จำเป็นต้องจัดหาครุภัณฑ์ อุปกรณ์ และสิ่งอำนวยความสะดวกในการจัดบริการรักษาพยาบาล จึงได้จัดกิจกรรมทอดผ้าป่าสามัคคีขึ้น เพื่อจัดหาทุนพัฒนาอาคารในวันที่ 24 กันยายน พ.ศ. 2558 โดยได้รับเงินบริจาคจากผู้มีจิตศรัทธามากกว่า 16 ล้านบาท สามารถพัฒนา และเปิดบริการผู้ป่วยนอกชั้น 1 และ ชั้น 2  เมื่อ 11 ธันวาคม พ.ศ. 2558 ต่อมาได้มีผู้มีจิตศรัทธาบริจาคสมทบเพิ่มเติม รวมเงินบริจาค ได้ทั้งสิ้น 37 ล้านบาทจึงสามารถพัฒนาอาคารได้ครบ และเปิดบริการได้ในทุกชั้น 

จากการประสานงานโดยนายสุวัฒน์  ชูศรี และนายประกิจ  สิมิวนิชย์  ต่อนายธนันต์  วงศ์ประเสริฐผล และครอบครัว ซึ่งเป็นผู้มีจิตศรัทธาและเห็นว่าโรงพยาบาล ควรได้รับการพัฒนาให้ก้าวหน้าโดยเฉพาะเรื่องการฟอกไต จึงได้บริจาคเงินจำนวน 23,920,000 บาท เพื่อสร้างอาคารผู้ป่วย 5 ชั้น  โดยมีนายจุรินทร์  ลักษณวิศิษฐ์  รัฐมนตรีว่าการกระทรวงสาธารณสุข เป็นประธานในพิธีวางศิลาฤกษ์ พร้อมอาคารผู้ป่วยนอกและอุบัติเหตุ  เมื่อวันอาทิตย์ที่ 24 เมษายน พ.ศ. 2554 

ในวันที่ 11 กันยายน พ.ศ. 2555 โรงพยาบาลกระทุ่มแบน ได้รับการยกฐานะ เป็นโรงพยาบาลทั่วไป ขนาด 250 เตียง  จึงเป็นจุดเปลี่ยนสำคัญในการพัฒนาอย่างต่อเนื่อง สู่โรงพยาบาลตติยภูมิที่มีคุณภาพ และมีพิธีเปิด “อาคารธนันต์-เหมียว วงศ์ประเสริฐผล” อย่างเป็นทางการและทำพิธีส่งมอบอาคาร เมื่อวันที่ 12 มกราคม พ.ศ. 2557 และในปี พ.ศ. 2559 กระทรวงสาธารณสุขให้งบประมาณ 299,688,000 บาท ในก่อสร้างอาคาร ผู้ป่วยนอก-ผู้ป่วยใน คสล. 10 ชั้น 1 หลัง  ได้มีพิธีวางศิลาฤกษ์เมื่อวันที่  5 ตุลาคม พ.ศ. 2559 ก่อสร้างจะแล้วเสร็จในปลายปีพ.ศ. 2563 

ปัจจุบันโรงพยาบาลกระทุ่มแบน เปิดทำการมาครบ 46 ปี  ขณะนี้เป็นโรงพยาบาลระดับตติยภูมิ ขนาด 250 เตียง (บริการจริง 350 เตียง) โดยมี นายแพทย์ธรรมวิทย์ เกื้อกูลเกียรติ  เป็นผู้อำนวยการ ตลอดเวลาที่ผ่านมาโรงพยาบาลมีความเจริญก้าวหน้าพัฒนาอย่างต่อเนื่องจนถึงทุกวันนี้ ด้วยความสนับสนุนเป็นอย่างดี จากคณะกรรมการบริหารโรงพยาบาล ภาคประชาชน คณะกรรมการมูลนิธิโรงพยาบาลกระทุ่มแบน หน่วยงานทุกภาคส่วน ผู้มีจิตศรัทธา ตลอดจนพี่น้องประชาชนทั้งภายในและภายนอกอำเภอกระทุ่มแบน จังหวัดสมุทรสาคร 

กลุ่มงานวิจัยและพัฒนาวิชาการเป็นกลุ่มงานที่สนับสนุน การพัฒนางานวิจัย (Research), งานวิจัยจากงานประจำ (Routine to Research: R2R), การสร้างสรรค์นวัตกรรม (Innovation) และกระบวนการแลกเปลี่ยนเรียนรู้ทางวิชาการ สนับสนุนการจัดโครงการบริการวิชาการ ประสานสนับสนุนการฝึกปฏิบัติทางการพยาบาล และการพัฒนาคุณภาพงานบริการจากหลักฐานเชิงประจักษ์ของโรงพยาบาลกระทุ่มแบน